More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7538 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  89.04 
 
 		 428 aa  737    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 430 aa  837    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  61.14 
 
 		 445 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  59.95 
 
 		 450 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  67.34 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  55.69 
 
 		 443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  51.95 
 
 		 442 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  51.99 
 
 		 432 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  55.71 
 
 		 430 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  52.69 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  56.59 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  49.18 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  53.73 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  56.07 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  52.06 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  54.52 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  51 
 
 		 439 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  51.09 
 
 		 435 aa  398  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  51.2 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  50.23 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  47.2 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  47.9 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  46.67 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  48.48 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  48.51 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  46.59 
 
 		 441 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  46.02 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  45.84 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  45.84 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  48.76 
 
 		 444 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  46.23 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  47.78 
 
 		 440 aa  364  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  48.94 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  48.35 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  47.42 
 
 		 435 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 437 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  45.39 
 
 		 440 aa  360  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 441 aa  359  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 437 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  47.25 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  42.32 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 454 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 440 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 440 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  48.24 
 
 		 439 aa  354  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  47.28 
 
 		 462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0776  major facilitator transporter  48 
 
 		 439 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  43.42 
 
 		 435 aa  353  5e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  47.57 
 
 		 442 aa  352  8e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05840  tartrate transporter  43.62 
 
 		 472 aa  352  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  49.37 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  48.68 
 
 		 442 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  46.36 
 
 		 439 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4836  major facilitator transporter  48.58 
 
 		 452 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  49.01 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  49.37 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  49.37 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  48.88 
 
 		 434 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 441 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 441 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  46.6 
 
 		 426 aa  348  7e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  48.87 
 
 		 434 aa  348  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  45.77 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 		 449 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  43.83 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.63 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  46.12 
 
 		 433 aa  346  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 452 aa  346  5e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  45.28 
 
 		 454 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  45.28 
 
 		 454 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  47.69 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  44.07 
 
 		 469 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  44.07 
 
 		 440 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  46.86 
 
 		 444 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  44.07 
 
 		 440 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  44.07 
 
 		 440 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  47.63 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  46.01 
 
 		 474 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  44.07 
 
 		 440 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 459 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  44.07 
 
 		 440 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 459 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 449 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>