More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1996 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  78.62 
 
 		 435 aa  684    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  79.08 
 
 		 437 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  80.23 
 
 		 440 aa  677    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  100 
 
 		 435 aa  853    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  78.96 
 
 		 433 aa  619  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  58.63 
 
 		 449 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  59.72 
 
 		 452 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  60.19 
 
 		 452 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  56.94 
 
 		 458 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3079  major facilitator transporter  55.97 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  44.83 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  47.1 
 
 		 432 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  45.72 
 
 		 428 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  43.31 
 
 		 442 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  45.67 
 
 		 430 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 443 aa  354  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  45.81 
 
 		 431 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  43.57 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  43.66 
 
 		 432 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 462 aa  348  7e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  47.39 
 
 		 432 aa  346  4e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  42.62 
 
 		 432 aa  345  7e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  45.63 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  43.74 
 
 		 439 aa  342  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  42.72 
 
 		 444 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  46.34 
 
 		 442 aa  341  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  43.59 
 
 		 433 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.5 
 
 		 439 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  43.59 
 
 		 443 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  45.39 
 
 		 444 aa  338  9e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 437 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  45.63 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  45.63 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  45.63 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  46.02 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  43.74 
 
 		 439 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 459 aa  335  7e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  43.3 
 
 		 450 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  45.15 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  45.32 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  45.15 
 
 		 434 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 		 424 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  47.42 
 
 		 430 aa  332  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  43.36 
 
 		 440 aa  329  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 437 aa  329  6e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 441 aa  328  9e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  46.57 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 435 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 		 439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 435 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 433 aa  324  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  44.25 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  44.22 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 436 aa  323  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 436 aa  323  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 445 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  43.73 
 
 		 444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  43.35 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  43.5 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 439 aa  316  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 437 aa  315  7e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 440 aa  315  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 435 aa  315  9e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  42.36 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 		 444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 441 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  41.93 
 
 		 454 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 452 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  40.37 
 
 		 449 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  43.95 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 441 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  43.02 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 454 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 441 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  39.67 
 
 		 442 aa  310  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  39.1 
 
 		 443 aa  309  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5327  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 436 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>