More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5999 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
430 aa  852    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  79.1 
 
 
431 aa  656    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  95.12 
 
 
430 aa  777    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  67.99 
 
 
435 aa  596  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  65.01 
 
 
441 aa  502  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  64.46 
 
 
445 aa  474  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2075  major facilitator transporter  60.82 
 
 
435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1472  major facilitator transporter  62.77 
 
 
448 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  52.98 
 
 
441 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5327  major facilitator transporter  52.11 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3497  major facilitator transporter  51.61 
 
 
436 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.61978  hitchhiker  0.00838162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2524  major facilitator transporter  51.36 
 
 
436 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3542  major facilitator transporter  70.59 
 
 
306 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7147  major facilitator superfamily MFS_1  52.45 
 
 
435 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.604995 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5094  major facilitator transporter  50.87 
 
 
436 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0811378  normal  0.190217 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  46.98 
 
 
449 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3929  major facilitator transporter  51.12 
 
 
436 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3591  major facilitator transporter  51.12 
 
 
436 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163155  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  43.06 
 
 
432 aa  361  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  45.67 
 
 
435 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  46.08 
 
 
439 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  45.99 
 
 
435 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  45.99 
 
 
437 aa  358  8e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  44.91 
 
 
442 aa  358  8e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  45.39 
 
 
440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  42.15 
 
 
432 aa  352  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  45.97 
 
 
458 aa  349  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  42.38 
 
 
437 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  46.68 
 
 
444 aa  346  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  46.56 
 
 
442 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 
445 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  45.37 
 
 
434 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  45.84 
 
 
434 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  45.84 
 
 
434 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  45.84 
 
 
434 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1097  major facilitator family transporter  52.1 
 
 
431 aa  344  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0387869  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  47.03 
 
 
444 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  44.31 
 
 
443 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  45.41 
 
 
452 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  45.65 
 
 
440 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  45.41 
 
 
452 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  46.21 
 
 
436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.42 
 
 
439 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  44.18 
 
 
439 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  44.1 
 
 
437 aa  343  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  44.37 
 
 
454 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  43.82 
 
 
452 aa  341  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  45.37 
 
 
434 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  44.89 
 
 
434 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  43.03 
 
 
441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  45.13 
 
 
434 aa  338  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  43.03 
 
 
441 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  43.03 
 
 
441 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  43.03 
 
 
441 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  43.16 
 
 
432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  42.55 
 
 
441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  42.55 
 
 
441 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  45.14 
 
 
445 aa  336  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  43.16 
 
 
428 aa  335  7e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  41.22 
 
 
432 aa  335  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.69 
 
 
441 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1389  major facilitator family transporter  51.34 
 
 
751 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  41.53 
 
 
433 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0215  major facilitator family transporter  51.34 
 
 
751 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  46.57 
 
 
433 aa  333  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0950  major facilitator family transporter  51.34 
 
 
751 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.601633  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  43.6 
 
 
443 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1799  major facilitator family transporter  51.34 
 
 
431 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118328  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0348  major facilitator family transporter  51.34 
 
 
431 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3079  major facilitator transporter  44.89 
 
 
457 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1884  major facilitator family transporter  51.34 
 
 
431 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530062  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  44.78 
 
 
432 aa  333  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0430  major facilitator family transporter  51.34 
 
 
797 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  42.65 
 
 
469 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.65 
 
 
440 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  42.65 
 
 
440 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  41.33 
 
 
434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  42.65 
 
 
440 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  42.65 
 
 
440 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  42.65 
 
 
440 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 
430 aa  328  8e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  42.31 
 
 
469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5189  major facilitator transporter  50.99 
 
 
435 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.593783  normal  0.0498797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  42.41 
 
 
451 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  41.81 
 
 
442 aa  325  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  47.78 
 
 
443 aa  325  8.000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  41.55 
 
 
441 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  43.22 
 
 
441 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5738  major facilitator superfamily MFS_1  43.15 
 
 
445 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  40.62 
 
 
442 aa  322  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  41.94 
 
 
445 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  42.99 
 
 
441 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  42.06 
 
 
443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  41.15 
 
 
462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  43.5 
 
 
433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  42.54 
 
 
436 aa  319  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 
444 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  43.26 
 
 
433 aa  318  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  44.26 
 
 
435 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>