More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49260 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  100 
 
 
433 aa  853    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  78.96 
 
 
435 aa  652    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  77.83 
 
 
435 aa  651    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  78.07 
 
 
437 aa  653    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  78.25 
 
 
440 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  56.6 
 
 
449 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  58.12 
 
 
452 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  58.35 
 
 
452 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  57.62 
 
 
458 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3079  major facilitator transporter  54.35 
 
 
457 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  45.94 
 
 
435 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  46.52 
 
 
439 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 
430 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  45.18 
 
 
432 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  43.06 
 
 
428 aa  358  8e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  42.02 
 
 
432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  42.76 
 
 
442 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  42.79 
 
 
432 aa  353  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  46.57 
 
 
430 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  45.54 
 
 
459 aa  348  9e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  49.21 
 
 
443 aa  348  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  42.22 
 
 
432 aa  347  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  47.88 
 
 
432 aa  346  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  44.04 
 
 
450 aa  346  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 
444 aa  343  5e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  44.81 
 
 
431 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  42.08 
 
 
462 aa  342  9e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  45.24 
 
 
444 aa  340  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  44.16 
 
 
430 aa  339  7e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 
439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  41.59 
 
 
433 aa  336  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  42.79 
 
 
443 aa  335  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 
444 aa  332  8e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  42.64 
 
 
424 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  43.53 
 
 
435 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  44.16 
 
 
430 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  45.07 
 
 
441 aa  329  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  43.36 
 
 
445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  41.81 
 
 
441 aa  325  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  41.84 
 
 
439 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 
433 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  41.84 
 
 
434 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  41.09 
 
 
454 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  41.84 
 
 
434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  40.52 
 
 
437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  41.84 
 
 
434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  41.84 
 
 
434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 
439 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  43.08 
 
 
453 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  40.05 
 
 
437 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  42.52 
 
 
442 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  44.27 
 
 
433 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  41.61 
 
 
434 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  43.04 
 
 
435 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.13 
 
 
439 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 
440 aa  316  6e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  41.88 
 
 
436 aa  315  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  41.37 
 
 
434 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  42 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  45.56 
 
 
445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 
444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  41.61 
 
 
444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  38.39 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  39.43 
 
 
437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  43.03 
 
 
434 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  42.18 
 
 
442 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  41.43 
 
 
441 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  41.52 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 
440 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  41.19 
 
 
441 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  40.24 
 
 
443 aa  309  6.999999999999999e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  39.62 
 
 
442 aa  308  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  41.06 
 
 
441 aa  308  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  41.46 
 
 
440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  41.23 
 
 
441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  40.94 
 
 
451 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  39.2 
 
 
454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  41.61 
 
 
436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  41.08 
 
 
459 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  42.61 
 
 
439 aa  306  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  42.17 
 
 
435 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  41.19 
 
 
441 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 
449 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  41.19 
 
 
441 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  41.19 
 
 
441 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  41.36 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  42.17 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  37.67 
 
 
455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 
444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  42.17 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  42.15 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  41.36 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  39.86 
 
 
434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  41.31 
 
 
437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  39.53 
 
 
444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  42.23 
 
 
452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 
441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 
441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.07 
 
 
442 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 
440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>