More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4248 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  100 
 
 		 431 aa  857    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  78.86 
 
 		 430 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  79.1 
 
 		 430 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  68.63 
 
 		 435 aa  590  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  63.46 
 
 		 441 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  62.41 
 
 		 445 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2075  major facilitator transporter  63.48 
 
 		 435 aa  460  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1472  major facilitator transporter  61.85 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  51.44 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3497  major facilitator transporter  47.92 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.61978  hitchhiker  0.00838162 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5327  major facilitator transporter  47.92 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  46.34 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7147  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.604995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2524  major facilitator transporter  47.68 
 
 		 436 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3542  major facilitator transporter  68.38 
 
 		 306 aa  362  6e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 437 aa  358  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5094  major facilitator transporter  47.91 
 
 		 436 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0811378  normal  0.190217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 442 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  45.15 
 
 		 440 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  45.81 
 
 		 435 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  45.58 
 
 		 449 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  42.58 
 
 		 432 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  42.55 
 
 		 432 aa  349  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 439 aa  349  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  45.97 
 
 		 434 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  45.26 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  45.88 
 
 		 458 aa  342  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1097  major facilitator family transporter  50 
 
 		 431 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0387869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 437 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  47.17 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3591  major facilitator transporter  47.92 
 
 		 436 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3929  major facilitator transporter  47.68 
 
 		 436 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.42 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  46.68 
 
 		 444 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  44.55 
 
 		 439 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 434 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 437 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  42.44 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  47.03 
 
 		 444 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  46.63 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 436 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0348  major facilitator family transporter  49.29 
 
 		 431 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1799  major facilitator family transporter  49.29 
 
 		 431 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118328  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1884  major facilitator family transporter  49.29 
 
 		 431 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530062  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0215  major facilitator family transporter  49.29 
 
 		 751 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25421  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1389  major facilitator family transporter  49.29 
 
 		 751 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  48.56 
 
 		 443 aa  332  8e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0950  major facilitator family transporter  49.29 
 
 		 751 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.601633  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0430  major facilitator family transporter  49.29 
 
 		 797 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  44.25 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  44.61 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  43.91 
 
 		 449 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  44.76 
 
 		 432 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  43.4 
 
 		 445 aa  326  4.0000000000000003e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  43.61 
 
 		 433 aa  326  6e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  45.79 
 
 		 445 aa  325  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 434 aa  325  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  41.06 
 
 		 432 aa  325  9e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  43.37 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  42.55 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  44.76 
 
 		 450 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 454 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5189  major facilitator transporter  49.02 
 
 		 435 aa  319  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.593783  normal  0.0498797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  40.57 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  44.98 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  43.33 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.63 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 452 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  43.7 
 
 		 439 aa  316  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5738  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 		 445 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 444 aa  316  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2646  major facilitator superfamily MFS_1  42.18 
 
 		 453 aa  315  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  41.15 
 
 		 441 aa  315  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  42.02 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 444 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  41.23 
 
 		 469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  41.23 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  41.23 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  41.23 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.23 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  41.23 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>