More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4924 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  89.36 
 
 		 458 aa  724    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  99.12 
 
 		 452 aa  881    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  79.06 
 
 		 449 aa  665    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  100 
 
 		 452 aa  886    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3079  major facilitator transporter  71.07 
 
 		 457 aa  538  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  60.19 
 
 		 435 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  56.55 
 
 		 437 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  57.18 
 
 		 435 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  57.14 
 
 		 440 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  58.35 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 443 aa  358  8e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 435 aa  355  7.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 442 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  45.41 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  42.93 
 
 		 432 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 		 430 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  45.64 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 462 aa  342  5.999999999999999e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  45.41 
 
 		 431 aa  342  9e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  43.46 
 
 		 432 aa  339  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  44.42 
 
 		 451 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  47.21 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  45.75 
 
 		 432 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  43.32 
 
 		 440 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  41.91 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  45.67 
 
 		 440 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 459 aa  326  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  41.59 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  42.42 
 
 		 443 aa  323  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  40.97 
 
 		 433 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 440 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  41.96 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 435 aa  318  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2075  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 435 aa  317  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 443 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  44.26 
 
 		 442 aa  316  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  44.14 
 
 		 439 aa  317  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.49 
 
 		 439 aa  315  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  41.04 
 
 		 428 aa  315  9e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  42.73 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  42.49 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 437 aa  313  5.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  43.28 
 
 		 441 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 441 aa  312  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  43.44 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  40.61 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 		 430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 454 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 437 aa  310  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 442 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 450 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1472  major facilitator transporter  45.81 
 
 		 448 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137631 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  40.22 
 
 		 469 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  41.46 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  41.46 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 445 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  44.72 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  41.04 
 
 		 440 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  41.04 
 
 		 440 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  43.69 
 
 		 444 aa  307  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  41.04 
 
 		 440 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  41.04 
 
 		 440 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.04 
 
 		 440 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  43.96 
 
 		 439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.16 
 
 		 469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 441 aa  306  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  40.41 
 
 		 441 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 441 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 436 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 452 aa  305  9.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  42.18 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  43.67 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  43.62 
 
 		 445 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  43.67 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  40.18 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>