More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2075 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2075  major facilitator transporter  100 
 
 
435 aa  852    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  68.24 
 
 
441 aa  522  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  67.98 
 
 
445 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  63.48 
 
 
431 aa  502  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  60.14 
 
 
435 aa  499  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  60.66 
 
 
430 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  60.82 
 
 
430 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1472  major facilitator transporter  64.6 
 
 
448 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  51.32 
 
 
441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3497  major facilitator transporter  48.94 
 
 
436 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.61978  hitchhiker  0.00838162 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5327  major facilitator transporter  48.94 
 
 
436 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5094  major facilitator transporter  49.65 
 
 
436 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0811378  normal  0.190217 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2524  major facilitator transporter  48 
 
 
436 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3929  major facilitator transporter  49.18 
 
 
436 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3591  major facilitator transporter  48.94 
 
 
436 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163155  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7147  major facilitator superfamily MFS_1  52.71 
 
 
435 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.604995 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  45.39 
 
 
449 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  44.88 
 
 
432 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  43.45 
 
 
432 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  47.48 
 
 
458 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1097  major facilitator family transporter  53.98 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0387869  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  48.1 
 
 
439 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  45.31 
 
 
435 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  44.84 
 
 
437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  46.94 
 
 
440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  47.26 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  47.73 
 
 
432 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1389  major facilitator family transporter  52.34 
 
 
751 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0215  major facilitator family transporter  52.34 
 
 
751 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25421  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0348  major facilitator family transporter  54.09 
 
 
431 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  43.1 
 
 
437 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0430  major facilitator family transporter  52.34 
 
 
797 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1884  major facilitator family transporter  54.09 
 
 
431 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530062  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  45.41 
 
 
452 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1799  major facilitator family transporter  54.09 
 
 
431 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118328  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0950  major facilitator family transporter  52.34 
 
 
751 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.601633  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  45.18 
 
 
452 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  44.86 
 
 
437 aa  333  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  46.78 
 
 
434 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  45.63 
 
 
435 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  43.02 
 
 
432 aa  331  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  46.78 
 
 
434 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  49.34 
 
 
443 aa  330  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  47.26 
 
 
434 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3079  major facilitator transporter  44.89 
 
 
457 aa  329  5.0000000000000004e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  46.78 
 
 
434 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  46.78 
 
 
434 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  46.78 
 
 
434 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  43.1 
 
 
428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5189  major facilitator transporter  51.81 
 
 
435 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.593783  normal  0.0498797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  42.33 
 
 
442 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.76 
 
 
439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  44.12 
 
 
440 aa  319  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  45.5 
 
 
439 aa  319  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  43.53 
 
 
445 aa  319  6e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  43.48 
 
 
441 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  44.96 
 
 
436 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  41.63 
 
 
433 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  45.37 
 
 
450 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  44.52 
 
 
439 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 
441 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  45.11 
 
 
444 aa  316  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  43.1 
 
 
432 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  45.41 
 
 
442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  43.94 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  42.23 
 
 
459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.94 
 
 
443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  39.73 
 
 
455 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3542  major facilitator transporter  60.37 
 
 
306 aa  313  4.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  41.27 
 
 
452 aa  313  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  45.26 
 
 
435 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  40.28 
 
 
437 aa  312  6.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  40.05 
 
 
450 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  40.56 
 
 
442 aa  312  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  39.81 
 
 
450 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  43.45 
 
 
445 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  46.92 
 
 
435 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  40.37 
 
 
454 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  41.98 
 
 
434 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  41.51 
 
 
451 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  44.79 
 
 
444 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  46.92 
 
 
435 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  46.68 
 
 
435 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  44.78 
 
 
430 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  44.17 
 
 
440 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5738  major facilitator superfamily MFS_1  43.45 
 
 
445 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  40.6 
 
 
445 aa  309  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  47.69 
 
 
435 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  47.69 
 
 
435 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  47.69 
 
 
435 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  47.69 
 
 
435 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  43.26 
 
 
452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  40.47 
 
 
455 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  40 
 
 
433 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  40.66 
 
 
462 aa  306  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  40.71 
 
 
441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  40.71 
 
 
441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  40.52 
 
 
441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  40.94 
 
 
437 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  38.85 
 
 
450 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>