More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3642 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 445 aa  877    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  58.44 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  55.05 
 
 		 436 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  55.29 
 
 		 434 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  54.4 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  55.61 
 
 		 442 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  55.21 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  55.45 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  50.57 
 
 		 439 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  56 
 
 		 443 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  53.79 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  46.96 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  54.41 
 
 		 442 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2400  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2426  transporter, major facilitator family  47.2 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  47.2 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1403  major facilitator transporter  46.64 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.197119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2475  major facilitator family protein  47.2 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2388  major facilitator transporter  46.64 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02172  predicted transporter  46.4 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1412  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.787988  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  46.96 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09210  MFS transporter  55.53 
 
 		 467 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2634  major facilitator family transporter  46.96 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02131  hypothetical protein  46.4 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1456  major facilitator superfamily MFS_1  53.45 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  46.47 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  45.15 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 449 aa  353  5e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 454 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 442 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 434 aa  350  4e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 434 aa  350  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  49.6 
 
 		 442 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  49.6 
 
 		 442 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2512  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  42.25 
 
 		 437 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 437 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 442 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  44.62 
 
 		 444 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 434 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 434 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 434 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 436 aa  342  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  42.95 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 434 aa  339  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  43.56 
 
 		 439 aa  338  8e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.33 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  45.73 
 
 		 440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  43.97 
 
 		 434 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  46.85 
 
 		 430 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 441 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  44.73 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  39.9 
 
 		 428 aa  333  2e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  43.49 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  40.88 
 
 		 437 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  45.28 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  41.69 
 
 		 451 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 441 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  43.84 
 
 		 440 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  43.3 
 
 		 432 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  41.04 
 
 		 432 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  46.21 
 
 		 430 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  43.36 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  43.36 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  43.36 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 443 aa  329  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  46.33 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  48.59 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  45.96 
 
 		 430 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  42.86 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 435 aa  327  4.0000000000000003e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 444 aa  326  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  43.49 
 
 		 442 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  40.27 
 
 		 455 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 445 aa  325  9e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.17 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  42.17 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  43.82 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  42.17 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  42.62 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  42.17 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  42.17 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  42.17 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  44.32 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  44.39 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>