More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0888 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  100 
 
 		 449 aa  892    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  70.21 
 
 		 455 aa  611  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  46.87 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  44.27 
 
 		 445 aa  353  5e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 442 aa  352  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.99 
 
 		 442 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 443 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  43.49 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  46.04 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  43.53 
 
 		 440 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 439 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  45.59 
 
 		 439 aa  329  8e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  42.49 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  42.49 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2512  major facilitator transporter  42.49 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 		 440 aa  313  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  39.49 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  40.45 
 
 		 429 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2388  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 429 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1403  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 429 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.197119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2426  transporter, major facilitator family  40.45 
 
 		 429 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  40.45 
 
 		 429 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2475  major facilitator family protein  40.45 
 
 		 429 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2400  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02172  predicted transporter  39.8 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02131  hypothetical protein  39.8 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1412  major facilitator superfamily MFS_1  39.8 
 
 		 429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.787988  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09210  MFS transporter  43.16 
 
 		 467 aa  306  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 437 aa  306  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2634  major facilitator family transporter  40.2 
 
 		 429 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1456  major facilitator superfamily MFS_1  45.04 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  40.91 
 
 		 428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 437 aa  303  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 450 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  39.64 
 
 		 455 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  41.86 
 
 		 443 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 452 aa  294  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 441 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 441 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 441 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 441 aa  292  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  40.66 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.5 
 
 		 469 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 454 aa  289  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  40.78 
 
 		 433 aa  289  9e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  40.97 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  41.6 
 
 		 469 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  41.6 
 
 		 440 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  41.6 
 
 		 440 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  41.6 
 
 		 440 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  41.6 
 
 		 440 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 437 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.6 
 
 		 440 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 445 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 		 449 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  41.01 
 
 		 441 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 448 aa  282  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 448 aa  282  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 448 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 448 aa  279  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  39.47 
 
 		 451 aa  279  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  40.39 
 
 		 442 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 434 aa  277  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 434 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 434 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2646  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 453 aa  276  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 434 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 434 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  39.29 
 
 		 443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 442 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 442 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 442 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 436 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 		 443 aa  272  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  38.21 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 434 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 455 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 439 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  39.54 
 
 		 436 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>