More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3469 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  82.57 
 
 		 442 aa  700    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  81.65 
 
 		 442 aa  688    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  100 
 
 		 443 aa  868    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  67.57 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  65.55 
 
 		 436 aa  527  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  64.68 
 
 		 434 aa  517  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  62.81 
 
 		 439 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  58.82 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  63.64 
 
 		 437 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  58.94 
 
 		 440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  59.42 
 
 		 440 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  54.5 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09210  MFS transporter  62.89 
 
 		 467 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2400  major facilitator transporter  51.28 
 
 		 429 aa  411  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  51.17 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  51.17 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1403  major facilitator transporter  51.05 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.197119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2426  transporter, major facilitator family  51.17 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2475  major facilitator family protein  51.17 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2388  major facilitator transporter  51.05 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02172  predicted transporter  50.82 
 
 		 429 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1412  major facilitator superfamily MFS_1  50.82 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.787988  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02131  hypothetical protein  50.82 
 
 		 429 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2634  major facilitator family transporter  50.93 
 
 		 429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  49.51 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1456  major facilitator superfamily MFS_1  53.48 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  47.1 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 434 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 434 aa  361  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  43.69 
 
 		 449 aa  358  8e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2512  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 434 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  44.07 
 
 		 450 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  41.73 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 450 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  43.75 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  46.96 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 450 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 448 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  43.87 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  46.5 
 
 		 444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  43.63 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  47.91 
 
 		 430 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 		 443 aa  318  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  43.39 
 
 		 448 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  43.12 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  44.72 
 
 		 442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 452 aa  312  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  47.97 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  42.47 
 
 		 447 aa  310  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  43.25 
 
 		 437 aa  309  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 443 aa  308  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 		 433 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  44.55 
 
 		 432 aa  307  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 437 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4906  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 		 440 aa  306  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.291929  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 441 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 442 aa  302  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  41.04 
 
 		 469 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  41.04 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.04 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  40.57 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  41.04 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 462 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  41.04 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  41.04 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  39.67 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 441 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 441 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5498  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 455 aa  300  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 441 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 459 aa  299  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 441 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  45.64 
 
 		 445 aa  299  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 441 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5896  major facilitator transporter  43.28 
 
 		 455 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2181  major facilitator transporter  43.28 
 
 		 455 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576704  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  43.5 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 441 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2198  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2098  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 453 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  42.31 
 
 		 433 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  40.6 
 
 		 441 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  43.25 
 
 		 432 aa  296  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 441 aa  296  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 442 aa  295  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 442 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2220  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.896585  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  40.7 
 
 		 448 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>