More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4332 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  99.32 
 
 		 442 aa  867    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0604  membrane protein  83.75 
 
 		 445 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1274  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1830  major facilitator family transporter  83.75 
 
 		 445 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1121  major facilitator family transporter  84.21 
 
 		 445 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2336  membrane protein  83.75 
 
 		 445 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1035  major facilitator family transporter  83.75 
 
 		 445 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  871    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0863  membrane protein  83.75 
 
 		 445 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  94.32 
 
 		 442 aa  756    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  92.53 
 
 		 442 aa  741    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  92.76 
 
 		 442 aa  770    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  871    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2830  major facilitator family transporter  66.44 
 
 		 450 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4257  major facilitator transporter  65.16 
 
 		 444 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139885  normal  0.0686355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  59.54 
 
 		 456 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2859  major facilitator transporter  66.44 
 
 		 433 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2952  major facilitator transporter  67.25 
 
 		 433 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 		 445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  42.59 
 
 		 450 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  42.36 
 
 		 455 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 450 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  47.73 
 
 		 439 aa  323  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 436 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 450 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 443 aa  319  7e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  42.26 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  44.12 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  45.36 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0978  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 447 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  44.58 
 
 		 434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.23 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 439 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  45.36 
 
 		 441 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 448 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  45.78 
 
 		 442 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 434 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 434 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 434 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  42.11 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 448 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 448 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 448 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 437 aa  299  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  39.82 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 455 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 464 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  43.3 
 
 		 440 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  39.95 
 
 		 442 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  43.06 
 
 		 440 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 448 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5537  major facilitator transporter  41 
 
 		 450 aa  296  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 434 aa  295  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  42.24 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  40 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  41.72 
 
 		 439 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 436 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 436 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 436 aa  293  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  38.64 
 
 		 442 aa  293  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  39.21 
 
 		 440 aa  293  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 		 433 aa  293  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  37.13 
 
 		 445 aa  292  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  41.78 
 
 		 432 aa  292  7e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  41.71 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  45.15 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  43.28 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  40.7 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 452 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 440 aa  290  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  42.57 
 
 		 437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  40.48 
 
 		 455 aa  289  8e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  42.24 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  38.76 
 
 		 451 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  39.1 
 
 		 441 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 462 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 441 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4601  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 437 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 459 aa  286  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 449 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  39.29 
 
 		 432 aa  286  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.67 
 
 		 439 aa  286  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4289  major facilitator superfamily transporter  37.1 
 
 		 437 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4223  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 437 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  39 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 		 430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  40.83 
 
 		 432 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 442 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 441 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>