More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2830 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2830  major facilitator family transporter  100 
 
 		 450 aa  888    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2952  major facilitator transporter  95.14 
 
 		 433 aa  716    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2859  major facilitator transporter  98.61 
 
 		 433 aa  845    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4257  major facilitator transporter  73.58 
 
 		 444 aa  582  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139885  normal  0.0686355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  65.65 
 
 		 456 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  66.44 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  66.67 
 
 		 442 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  66.67 
 
 		 442 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  68.59 
 
 		 442 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  66.9 
 
 		 442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  66.59 
 
 		 442 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1121  major facilitator family transporter  65.67 
 
 		 445 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0604  membrane protein  65.52 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1274  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2336  membrane protein  65.52 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1830  major facilitator family transporter  65.52 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0863  membrane protein  65.52 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1035  major facilitator family transporter  65.52 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 		 445 aa  318  9e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5537  major facilitator transporter  41.93 
 
 		 450 aa  316  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0978  major facilitator superfamily MFS_1  43.48 
 
 		 447 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 448 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 		 439 aa  306  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  39.29 
 
 		 455 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 450 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 450 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4601  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 437 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4289  major facilitator superfamily transporter  42.17 
 
 		 437 aa  299  6e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 		 443 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4223  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 437 aa  299  6e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 436 aa  299  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  42 
 
 		 428 aa  299  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  39.65 
 
 		 450 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 449 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 439 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  41.28 
 
 		 441 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  37.73 
 
 		 451 aa  292  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  41.28 
 
 		 448 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  43.9 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 437 aa  292  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 443 aa  292  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  40.82 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 445 aa  289  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 437 aa  287  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 		 439 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 434 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 454 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 452 aa  285  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 434 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.35 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 458 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  39.33 
 
 		 455 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 433 aa  283  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  41.05 
 
 		 442 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  38.7 
 
 		 447 aa  282  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  37.91 
 
 		 464 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 437 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 436 aa  279  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 436 aa  279  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 442 aa  279  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 442 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  39.75 
 
 		 442 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 435 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 442 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 442 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 454 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  38.41 
 
 		 442 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  39.44 
 
 		 452 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 440 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.67 
 
 		 442 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 437 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 441 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  37.72 
 
 		 433 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  41.39 
 
 		 430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  41.96 
 
 		 444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  38.41 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 441 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 448 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 448 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 424 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 442 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 436 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  38.97 
 
 		 435 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 434 aa  273  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>