More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4101 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
443 aa  890    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1091  major facilitator transporter  75.66 
 
 
455 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.768657  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2198  major facilitator transporter  75.18 
 
 
455 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5498  major facilitator transporter  75.18 
 
 
455 aa  620  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2220  major facilitator transporter  73.83 
 
 
453 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.896585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2098  major facilitator transporter  73.6 
 
 
453 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5896  major facilitator transporter  75.18 
 
 
455 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2181  major facilitator transporter  75.18 
 
 
455 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  68.9 
 
 
455 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  68.66 
 
 
450 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  68.42 
 
 
450 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  68.69 
 
 
455 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  67.7 
 
 
450 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  65.52 
 
 
464 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  65.42 
 
 
447 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  70.36 
 
 
441 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  70.36 
 
 
448 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  68.22 
 
 
448 aa  557  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  64.55 
 
 
442 aa  548  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  45.13 
 
 
436 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  37.35 
 
 
437 aa  319  6e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  40.47 
 
 
439 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  42.36 
 
 
442 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 
445 aa  318  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  42.01 
 
 
442 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  42.01 
 
 
442 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  42.06 
 
 
434 aa  316  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.89 
 
 
442 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  40.89 
 
 
445 aa  315  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  41.47 
 
 
442 aa  315  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  42.45 
 
 
437 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 
439 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  41.19 
 
 
440 aa  312  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  40.28 
 
 
441 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  40.19 
 
 
442 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  40.5 
 
 
440 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  40.9 
 
 
442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  41.19 
 
 
434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  41.2 
 
 
439 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  39.4 
 
 
441 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  40.09 
 
 
441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  40.33 
 
 
441 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  40.09 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  40.09 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.59 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  42.33 
 
 
436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 
439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  41.23 
 
 
434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  41.23 
 
 
434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  41.37 
 
 
444 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  41.23 
 
 
434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  41.65 
 
 
442 aa  307  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  40.09 
 
 
441 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  40.94 
 
 
434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  43.81 
 
 
443 aa  306  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  41.09 
 
 
459 aa  306  6e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  43.26 
 
 
443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  39.71 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  40.69 
 
 
434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  42.34 
 
 
433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  42.55 
 
 
442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  38.29 
 
 
462 aa  303  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  41.19 
 
 
435 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 
444 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  39.86 
 
 
469 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  42.12 
 
 
442 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  40.6 
 
 
443 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  39.62 
 
 
469 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  39.62 
 
 
440 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  39.62 
 
 
440 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  39.62 
 
 
440 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  39.62 
 
 
440 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  39.62 
 
 
440 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  39.05 
 
 
441 aa  299  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  39.18 
 
 
442 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  40.5 
 
 
435 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  40.33 
 
 
437 aa  297  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  39.16 
 
 
437 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  38.46 
 
 
435 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 
440 aa  296  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  40.52 
 
 
436 aa  296  7e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  40.52 
 
 
436 aa  296  7e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  39.29 
 
 
440 aa  295  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  40.74 
 
 
434 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  40.43 
 
 
436 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  38.67 
 
 
454 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  43.04 
 
 
442 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  40.33 
 
 
441 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  40.33 
 
 
441 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  37.74 
 
 
443 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  39.49 
 
 
433 aa  292  8e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 
441 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  38.34 
 
 
432 aa  292  8e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  36.52 
 
 
441 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  39.95 
 
 
442 aa  292  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  41.88 
 
 
442 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 
444 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  39.26 
 
 
433 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 
430 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  39.75 
 
 
456 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>