More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4767 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  97.56 
 
 
455 aa  884    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  77.26 
 
 
441 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  74.94 
 
 
448 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  73.21 
 
 
455 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  79.68 
 
 
448 aa  670    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  94.22 
 
 
450 aa  838    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  98.22 
 
 
450 aa  888    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  100 
 
 
450 aa  900    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  72.31 
 
 
464 aa  631  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  70.97 
 
 
447 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  69.86 
 
 
442 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  68.42 
 
 
443 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2198  major facilitator transporter  62.41 
 
 
455 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1091  major facilitator transporter  62.36 
 
 
455 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.768657  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5498  major facilitator transporter  62.88 
 
 
455 aa  522  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5896  major facilitator transporter  62.41 
 
 
455 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193247  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2220  major facilitator transporter  62.88 
 
 
453 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.896585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2181  major facilitator transporter  62.41 
 
 
455 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576704  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2098  major facilitator transporter  62.65 
 
 
453 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  43.09 
 
 
436 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 
442 aa  338  8e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.33 
 
 
442 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 
445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  39.49 
 
 
435 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  39.49 
 
 
437 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  40.93 
 
 
432 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  41.4 
 
 
434 aa  323  5e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  43.5 
 
 
442 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  43.5 
 
 
442 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  42.23 
 
 
445 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  43.5 
 
 
442 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  44.2 
 
 
439 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  41.86 
 
 
439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  39.22 
 
 
440 aa  319  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  41.24 
 
 
440 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  41.39 
 
 
442 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4257  major facilitator transporter  42.16 
 
 
444 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139885  normal  0.0686355 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  42.72 
 
 
442 aa  316  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  41.07 
 
 
433 aa  316  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  40.63 
 
 
440 aa  316  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  40.72 
 
 
437 aa  316  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  38.41 
 
 
437 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  40.82 
 
 
443 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  40.79 
 
 
432 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  42.65 
 
 
439 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  41.24 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  42.68 
 
 
436 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  43.04 
 
 
443 aa  309  5e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  44.91 
 
 
443 aa  310  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  41.36 
 
 
440 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  40.55 
 
 
432 aa  308  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 
440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  41.15 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  39.16 
 
 
459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  39.9 
 
 
443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  41.27 
 
 
456 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  38.3 
 
 
462 aa  306  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  41.09 
 
 
446 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  41.13 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  41.19 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  44.53 
 
 
437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  42.79 
 
 
437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  42.05 
 
 
443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.568518 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 
444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  41.5 
 
 
439 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  40.46 
 
 
454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  41.75 
 
 
434 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  40.9 
 
 
441 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.03 
 
 
439 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  40.9 
 
 
441 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  42.4 
 
 
442 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  39.86 
 
 
449 aa  302  7.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  42.59 
 
 
442 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  42.32 
 
 
441 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 
439 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  39.06 
 
 
441 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  40.38 
 
 
434 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 
455 aa  300  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  39.04 
 
 
433 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  42.86 
 
 
442 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  41.34 
 
 
433 aa  300  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  36.84 
 
 
442 aa  299  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  41.09 
 
 
433 aa  298  9e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  39.01 
 
 
441 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  43.01 
 
 
442 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  39.01 
 
 
441 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  40.43 
 
 
441 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  40.8 
 
 
434 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  40.93 
 
 
440 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  40.89 
 
 
440 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  41.06 
 
 
442 aa  296  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  39.52 
 
 
441 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  37.71 
 
 
436 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  39.52 
 
 
441 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  39.02 
 
 
440 aa  295  9e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  40.7 
 
 
437 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  39.71 
 
 
441 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  38.35 
 
 
441 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  40.75 
 
 
434 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  40.75 
 
 
434 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>