More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6283 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
442 aa  877    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  69.86 
 
 
450 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  71.46 
 
 
450 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  71.7 
 
 
455 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  72.71 
 
 
464 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  72.94 
 
 
455 aa  617  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  72.49 
 
 
447 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  71.67 
 
 
450 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  68.97 
 
 
448 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  64.55 
 
 
443 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  67.29 
 
 
441 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  67.53 
 
 
448 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1091  major facilitator transporter  63.81 
 
 
455 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.768657  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5896  major facilitator transporter  64.63 
 
 
455 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2181  major facilitator transporter  64.63 
 
 
455 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2198  major facilitator transporter  64.88 
 
 
455 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2220  major facilitator transporter  65.68 
 
 
453 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.896585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2098  major facilitator transporter  65.68 
 
 
453 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5498  major facilitator transporter  63.66 
 
 
455 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  45.39 
 
 
439 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  38.04 
 
 
435 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  41.86 
 
 
436 aa  324  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  42.96 
 
 
442 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  42.96 
 
 
442 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  37.86 
 
 
437 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  42.71 
 
 
442 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  38.21 
 
 
437 aa  319  7.999999999999999e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  38.33 
 
 
440 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  41.45 
 
 
439 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  42.89 
 
 
442 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  41.74 
 
 
440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  41.61 
 
 
442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 
442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4257  major facilitator transporter  41.81 
 
 
444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139885  normal  0.0686355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  39.01 
 
 
445 aa  306  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  38.63 
 
 
445 aa  306  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  39.95 
 
 
440 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  40.24 
 
 
469 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.29 
 
 
442 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  40.24 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  38.6 
 
 
433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  40.24 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  40.24 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  39.44 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  40.24 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  40.24 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  40.41 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  37.73 
 
 
442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  40 
 
 
469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  42.71 
 
 
442 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  42.02 
 
 
443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.568518 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  38.37 
 
 
433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  38.39 
 
 
459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  39.76 
 
 
437 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  40.64 
 
 
432 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  38.22 
 
 
443 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  39.81 
 
 
439 aa  299  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  38.57 
 
 
440 aa  299  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  40.71 
 
 
428 aa  296  4e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  38.39 
 
 
441 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  39.01 
 
 
434 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  37.85 
 
 
441 aa  296  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  39.47 
 
 
443 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  38.59 
 
 
432 aa  296  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  40.44 
 
 
428 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  38.78 
 
 
436 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  39.57 
 
 
439 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 
440 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  38.55 
 
 
441 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  37.74 
 
 
441 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  38.05 
 
 
443 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  38.17 
 
 
434 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  39.53 
 
 
456 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  38.72 
 
 
444 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  40.43 
 
 
445 aa  292  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2830  major facilitator family transporter  41.33 
 
 
450 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  37.86 
 
 
441 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  37.86 
 
 
441 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  38.44 
 
 
434 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  38.77 
 
 
434 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  38.77 
 
 
434 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  38.39 
 
 
434 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  38.77 
 
 
434 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  39.16 
 
 
442 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  37.86 
 
 
441 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  37.41 
 
 
443 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 
444 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  37.73 
 
 
440 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  38.39 
 
 
432 aa  289  6e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.14 
 
 
439 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  37.41 
 
 
441 aa  289  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  40.44 
 
 
442 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  38.65 
 
 
437 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2859  major facilitator transporter  41.28 
 
 
433 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  39.2 
 
 
477 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  39.26 
 
 
432 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 
439 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  37.47 
 
 
446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  38.19 
 
 
434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  36.19 
 
 
462 aa  286  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>