More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4758 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  94 
 
 		 450 aa  838    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  100 
 
 		 455 aa  912    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  77.37 
 
 		 441 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  76.71 
 
 		 448 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  97.56 
 
 		 450 aa  884    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  80.14 
 
 		 448 aa  671    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  99.33 
 
 		 450 aa  896    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  73.21 
 
 		 464 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  73.43 
 
 		 455 aa  631  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  71.66 
 
 		 447 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  71.7 
 
 		 442 aa  609  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  68.9 
 
 		 443 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1091  major facilitator transporter  63.74 
 
 		 455 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.768657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2220  major facilitator transporter  64.04 
 
 		 453 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.896585  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5498  major facilitator transporter  63.81 
 
 		 455 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2198  major facilitator transporter  63.33 
 
 		 455 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2098  major facilitator transporter  63.81 
 
 		 453 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5896  major facilitator transporter  63.33 
 
 		 455 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2181  major facilitator transporter  63.33 
 
 		 455 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576704  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  43.25 
 
 		 436 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.86 
 
 		 442 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 		 445 aa  325  8.000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  39.86 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  41.99 
 
 		 445 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  43.25 
 
 		 442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  43.25 
 
 		 442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4257  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139885  normal  0.0686355 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  43.25 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 440 aa  320  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  40.79 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  41.49 
 
 		 434 aa  319  7.999999999999999e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  43.95 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 442 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 439 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  38.88 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  41.47 
 
 		 440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 437 aa  313  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 439 aa  312  6.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  40.32 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 436 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  40.77 
 
 		 432 aa  309  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  41.59 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  41.09 
 
 		 432 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 459 aa  306  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  41.04 
 
 		 441 aa  306  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 443 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  41.27 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 446 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  44.27 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 		 440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  41.42 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 		 455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 434 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.28 
 
 		 439 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 462 aa  302  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 443 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  41.28 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 		 443 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  38.59 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  41.3 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  42.32 
 
 		 441 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 434 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 442 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  39.64 
 
 		 449 aa  299  7e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 442 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  41.73 
 
 		 433 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 454 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  38.25 
 
 		 441 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 441 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 440 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  40 
 
 		 441 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  41.48 
 
 		 433 aa  296  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 436 aa  296  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 440 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  37.41 
 
 		 441 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  40.93 
 
 		 440 aa  293  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>