More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0732 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 455 aa  891    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  70.21 
 
 		 449 aa  611  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  46.47 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  47.38 
 
 		 436 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  46.44 
 
 		 442 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  48.15 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.39 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  45.83 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  47.87 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  44.8 
 
 		 439 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  44.84 
 
 		 440 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  46.38 
 
 		 442 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  45.07 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2400  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 437 aa  323  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1403  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 429 aa  323  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.197119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2388  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 429 aa  323  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1456  major facilitator superfamily MFS_1  46.75 
 
 		 446 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02172  predicted transporter  40.05 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02131  hypothetical protein  40.05 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1412  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.787988  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2475  major facilitator family protein  40.39 
 
 		 429 aa  319  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  40.39 
 
 		 429 aa  319  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2426  transporter, major facilitator family  40.39 
 
 		 429 aa  319  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  40.39 
 
 		 429 aa  318  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 433 aa  316  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2634  major facilitator family transporter  40.15 
 
 		 429 aa  315  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 437 aa  305  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  41.55 
 
 		 455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  41.31 
 
 		 450 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 450 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  40.9 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09210  MFS transporter  44.79 
 
 		 467 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  40.9 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2512  major facilitator transporter  40.66 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 450 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  40.97 
 
 		 437 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  39.72 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 452 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  43.11 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  38.41 
 
 		 432 aa  286  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 442 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 442 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  42.06 
 
 		 443 aa  286  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 		 441 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 441 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 464 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 		 440 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 443 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.21 
 
 		 469 aa  280  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 441 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 441 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 448 aa  279  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 442 aa  279  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  41.35 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 441 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 441 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  40.7 
 
 		 469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  41.07 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  36.16 
 
 		 443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  39.17 
 
 		 441 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  40.7 
 
 		 440 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  40.7 
 
 		 440 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 448 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  40.7 
 
 		 440 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 442 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  40.7 
 
 		 440 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  40.7 
 
 		 440 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  39.7 
 
 		 445 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  40.68 
 
 		 434 aa  273  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 430 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  39.33 
 
 		 447 aa  272  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  39.56 
 
 		 444 aa  272  9e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2646  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  38.28 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 444 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  40.7 
 
 		 459 aa  270  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  40.57 
 
 		 424 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 443 aa  269  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  37.05 
 
 		 462 aa  269  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  39.95 
 
 		 433 aa  269  8.999999999999999e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  39.95 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 441 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5498  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 455 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>