More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2634 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02172  predicted transporter  91.38 
 
 		 429 aa  789    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1412  major facilitator superfamily MFS_1  91.38 
 
 		 429 aa  788    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.787988  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2426  transporter, major facilitator family  99.77 
 
 		 429 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02131  hypothetical protein  91.38 
 
 		 429 aa  789    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  99.53 
 
 		 429 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2388  major facilitator transporter  91.61 
 
 		 429 aa  791    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2475  major facilitator family protein  99.77 
 
 		 429 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1403  major facilitator transporter  91.61 
 
 		 429 aa  791    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.197119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2400  major facilitator transporter  92.07 
 
 		 429 aa  793    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2634  major facilitator family transporter  100 
 
 		 429 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  99.53 
 
 		 429 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  54.61 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  54.61 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2512  major facilitator transporter  54.61 
 
 		 434 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3384  major facilitator superfamily MFS_1  88.89 
 
 		 252 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  50.59 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  51.53 
 
 		 442 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.17 
 
 		 442 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  50.95 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  46.96 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  52 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  52.28 
 
 		 443 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  47.37 
 
 		 440 aa  362  9e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  48.99 
 
 		 442 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  46.65 
 
 		 440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09210  MFS transporter  48.72 
 
 		 467 aa  346  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3387  transporter, major facilitator family  95.38 
 
 		 185 aa  336  5e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 433 aa  325  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 455 aa  315  8e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1456  major facilitator superfamily MFS_1  44.36 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 449 aa  305  7e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  36.47 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  38.12 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  40.89 
 
 		 430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  37.96 
 
 		 432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 442 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 442 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 442 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  42.39 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  39.58 
 
 		 444 aa  266  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 440 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 455 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  36.54 
 
 		 451 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  40.57 
 
 		 441 aa  264  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 436 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 436 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 436 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 437 aa  262  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 443 aa  262  6.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 437 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  39.86 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  38.5 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  38.86 
 
 		 433 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 437 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 435 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 450 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  34.52 
 
 		 455 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 434 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  39.03 
 
 		 432 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 440 aa  255  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 450 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  37.24 
 
 		 432 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 442 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  37.05 
 
 		 440 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  37.05 
 
 		 440 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  37.05 
 
 		 440 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  37.05 
 
 		 440 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  37.05 
 
 		 440 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 455 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0039  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 438 aa  252  9.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  37.05 
 
 		 469 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 464 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  37.32 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  39.79 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  37.02 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  42.27 
 
 		 437 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 442 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 444 aa  250  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 436 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  36.56 
 
 		 469 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 450 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  38.28 
 
 		 440 aa  249  7e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4048  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 442 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707986  normal  0.777424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 448 aa  249  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  37.34 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>