More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0039 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0039  major facilitator transporter  100 
 
 		 438 aa  874    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  65.48 
 
 		 436 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  65.23 
 
 		 435 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0632064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  65.23 
 
 		 466 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3541  major facilitator transporter  64.97 
 
 		 435 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51300  major facilitator superfamily (MFS) permease  65.08 
 
 		 440 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  43.12 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 437 aa  333  4e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  42.76 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 436 aa  322  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 		 440 aa  322  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  41.61 
 
 		 432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 443 aa  316  6e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 444 aa  315  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  41 
 
 		 426 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  42 
 
 		 441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  42.62 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 435 aa  312  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  44.1 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  43.53 
 
 		 437 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 		 432 aa  308  9e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  40.9 
 
 		 443 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  42.34 
 
 		 439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  37.71 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 441 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 441 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.9 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  41.51 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  42.07 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  40.13 
 
 		 445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  42.69 
 
 		 444 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 454 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 441 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 444 aa  300  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  37.15 
 
 		 459 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  40.57 
 
 		 444 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 440 aa  299  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 441 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 437 aa  299  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  42.55 
 
 		 430 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  42.28 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  40.92 
 
 		 442 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  42.03 
 
 		 430 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 439 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  40.39 
 
 		 469 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 462 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 		 441 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 440 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  40.39 
 
 		 440 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  40.39 
 
 		 440 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  40.39 
 
 		 440 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  40.39 
 
 		 440 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 437 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  40.39 
 
 		 440 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 440 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 434 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 441 aa  295  9e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2646  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 		 453 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 437 aa  294  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 440 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 440 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  39.61 
 
 		 469 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 448 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  37.56 
 
 		 440 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 448 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 439 aa  292  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 448 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 439 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  39.28 
 
 		 456 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  41.28 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 459 aa  289  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>