More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2426 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02172  predicted transporter  91.61 
 
 
429 aa  791    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1412  major facilitator superfamily MFS_1  91.61 
 
 
429 aa  791    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.787988  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2388  major facilitator transporter  91.84 
 
 
429 aa  794    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1403  major facilitator transporter  91.84 
 
 
429 aa  794    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.197119  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2400  major facilitator transporter  92.31 
 
 
429 aa  796    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2426  transporter, major facilitator family  100 
 
 
429 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  99.77 
 
 
429 aa  844    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  99.77 
 
 
429 aa  844    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02131  hypothetical protein  91.61 
 
 
429 aa  791    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2634  major facilitator family transporter  99.77 
 
 
429 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2475  major facilitator family protein  100 
 
 
429 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424058  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  54.85 
 
 
434 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  54.85 
 
 
434 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2512  major facilitator transporter  54.85 
 
 
434 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3384  major facilitator superfamily MFS_1  89.29 
 
 
252 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  50.83 
 
 
436 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  51.76 
 
 
442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  50.24 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.4 
 
 
442 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  51.19 
 
 
439 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  47.2 
 
 
445 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  52.25 
 
 
437 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  52.54 
 
 
443 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  47.61 
 
 
440 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  49.25 
 
 
442 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  46.45 
 
 
439 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  46.89 
 
 
440 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09210  MFS transporter  48.95 
 
 
467 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3387  transporter, major facilitator family  95.38 
 
 
185 aa  335  7e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  42.69 
 
 
433 aa  328  8e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  40.39 
 
 
455 aa  319  7.999999999999999e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1456  major facilitator superfamily MFS_1  44.61 
 
 
446 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  40.45 
 
 
449 aa  309  8e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  36.71 
 
 
428 aa  292  1e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  38.57 
 
 
437 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  38.37 
 
 
435 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 
430 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  38.19 
 
 
432 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  39.53 
 
 
442 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  39.53 
 
 
442 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  39.27 
 
 
442 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  38.37 
 
 
442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  42.64 
 
 
445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
449 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  39 
 
 
448 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 
444 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  39 
 
 
448 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  39 
 
 
448 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  37.38 
 
 
443 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  37.96 
 
 
455 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  36.78 
 
 
451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  37.35 
 
 
440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  38.05 
 
 
436 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  38.05 
 
 
436 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  40.81 
 
 
441 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  38.05 
 
 
436 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  36.7 
 
 
437 aa  266  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  43.09 
 
 
443 aa  265  8.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  39.32 
 
 
444 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  36.14 
 
 
437 aa  265  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  40.05 
 
 
432 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 
440 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  37.68 
 
 
437 aa  263  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  38.44 
 
 
433 aa  262  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  38.57 
 
 
435 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  38.8 
 
 
428 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  34.75 
 
 
455 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  34.99 
 
 
450 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  36.02 
 
 
434 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  39.26 
 
 
432 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  38.57 
 
 
440 aa  259  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  34.52 
 
 
450 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  37.94 
 
 
442 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  36.97 
 
 
443 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  36.64 
 
 
459 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  34.53 
 
 
455 aa  256  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  37.29 
 
 
440 aa  256  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  37.29 
 
 
440 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  37.29 
 
 
440 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  37.29 
 
 
440 aa  256  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  37.29 
 
 
440 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  35.25 
 
 
464 aa  256  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  37.29 
 
 
469 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0039  major facilitator transporter  35.32 
 
 
438 aa  255  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  37.56 
 
 
442 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  37.26 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  37.24 
 
 
432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  37.92 
 
 
442 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  42.53 
 
 
437 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 
444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  36.8 
 
 
469 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  39.79 
 
 
442 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  34.2 
 
 
450 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  37.44 
 
 
436 aa  253  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 
440 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  36.03 
 
 
448 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4048  major facilitator transporter  37.9 
 
 
442 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707986  normal  0.777424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  36.22 
 
 
456 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 
424 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  34.63 
 
 
447 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>