More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3387 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3387  transporter, major facilitator family  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1403  major facilitator transporter  100 
 
 		 429 aa  348  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.197119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2388  major facilitator transporter  100 
 
 		 429 aa  348  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2400  major facilitator transporter  99.42 
 
 		 429 aa  346  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02172  predicted transporter  99.42 
 
 		 429 aa  345  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1412  major facilitator superfamily MFS_1  99.42 
 
 		 429 aa  345  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.787988  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02131  hypothetical protein  99.42 
 
 		 429 aa  345  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2634  major facilitator family transporter  95.38 
 
 		 429 aa  336  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  95.38 
 
 		 429 aa  335  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  95.38 
 
 		 429 aa  335  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2475  major facilitator family protein  95.38 
 
 		 429 aa  335  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2426  transporter, major facilitator family  95.38 
 
 		 429 aa  335  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  56.63 
 
 		 434 aa  199  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  56.63 
 
 		 436 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  54.76 
 
 		 434 aa  198  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  54.76 
 
 		 434 aa  198  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2512  major facilitator transporter  54.76 
 
 		 434 aa  196  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  58.43 
 
 		 442 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  57.23 
 
 		 439 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  57.23 
 
 		 442 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  57.23 
 
 		 443 aa  193  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  53.8 
 
 		 433 aa  189  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  53.89 
 
 		 440 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  53.29 
 
 		 440 aa  187  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  53.01 
 
 		 442 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  55.13 
 
 		 437 aa  180  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  51.18 
 
 		 445 aa  178  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  51.81 
 
 		 439 aa  177  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  49.12 
 
 		 432 aa  170  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  50.88 
 
 		 432 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09210  MFS transporter  53.59 
 
 		 467 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  48.54 
 
 		 432 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  47.95 
 
 		 433 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  48.78 
 
 		 435 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0632064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  45.12 
 
 		 455 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3541  major facilitator transporter  48.78 
 
 		 435 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 449 aa  160  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  48.17 
 
 		 466 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  48.15 
 
 		 428 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  45.4 
 
 		 442 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  45.4 
 
 		 442 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  45.98 
 
 		 442 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 459 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  45.98 
 
 		 442 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 437 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  47.56 
 
 		 436 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 440 aa  158  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0039  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 438 aa  157  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  43.56 
 
 		 435 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  44.83 
 
 		 442 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  45.78 
 
 		 434 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  44.83 
 
 		 442 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  49.68 
 
 		 433 aa  155  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4257  major facilitator transporter  48.08 
 
 		 444 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139885  normal  0.0686355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  46.63 
 
 		 435 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  47.34 
 
 		 430 aa  155  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  46.67 
 
 		 445 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1456  major facilitator superfamily MFS_1  47.62 
 
 		 446 aa  154  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62445  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4601  major facilitator transporter  44.1 
 
 		 437 aa  154  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4223  major facilitator transporter  44.1 
 
 		 437 aa  154  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4289  major facilitator superfamily transporter  44.1 
 
 		 437 aa  154  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  50.29 
 
 		 437 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51300  major facilitator superfamily (MFS) permease  44.59 
 
 		 440 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10600  putative MFS transporter  46.58 
 
 		 434 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 436 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  46.2 
 
 		 450 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 436 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 436 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  46.45 
 
 		 433 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 441 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  45.03 
 
 		 441 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  48.05 
 
 		 443 aa  149  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 441 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2952  major facilitator transporter  50.67 
 
 		 433 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  45.81 
 
 		 433 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 477 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 441 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3501  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 435 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  44.97 
 
 		 441 aa  148  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  47.02 
 
 		 449 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0978  major facilitator superfamily MFS_1  43.2 
 
 		 447 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0966  MFS family transporter  44.72 
 
 		 434 aa  148  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.754862  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  47.13 
 
 		 443 aa  147  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2859  major facilitator transporter  50 
 
 		 433 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  44.51 
 
 		 441 aa  147  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  44.97 
 
 		 469 aa  147  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  43.54 
 
 		 433 aa  147  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2830  major facilitator family transporter  49.33 
 
 		 450 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  44.64 
 
 		 440 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  44.38 
 
 		 443 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 441 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5537  major facilitator transporter  44.58 
 
 		 450 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  41.32 
 
 		 443 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 449 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  43.98 
 
 		 440 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  43.98 
 
 		 440 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  43.98 
 
 		 440 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3214  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 440 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  43.98 
 
 		 440 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  45.78 
 
 		 444 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>