More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3501 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3501  major facilitator transporter  100 
 
 		 435 aa  866    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0966  MFS family transporter  74.65 
 
 		 434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.754862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10600  putative MFS transporter  75.84 
 
 		 434 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  50.94 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  44.75 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  49.07 
 
 		 442 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  46.12 
 
 		 441 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  46.52 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  46.95 
 
 		 444 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  47.24 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  47 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  47 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  46.76 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  47 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 437 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  48.08 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  46.48 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  45.69 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 443 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 442 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 443 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  46.76 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  43.64 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  45.92 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  44.32 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 442 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  44.94 
 
 		 451 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  45.9 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  44.66 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  44.88 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  48.73 
 
 		 435 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  48.96 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  48.96 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  48.73 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  44.88 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  48.96 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  48.96 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  43.65 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 452 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  48.96 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0261  major facilitator superfamily permease  46.59 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  43.98 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1636  MFS transporter  46.82 
 
 		 441 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0172  major facilitator family transporter  46.82 
 
 		 441 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0200  major facilitator family transporter  45.88 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.16 
 
 		 439 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  44.5 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3214  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  44.26 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 436 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 436 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  44.11 
 
 		 440 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  42.76 
 
 		 469 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  42.76 
 
 		 440 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.76 
 
 		 440 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  42.76 
 
 		 440 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  42.76 
 
 		 440 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  42.76 
 
 		 440 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  44.7 
 
 		 441 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 462 aa  360  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 433 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3490  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 435 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000252104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4332  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 435 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.206712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4034  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 435 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 441 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  41.89 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.57 
 
 		 469 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  43.69 
 
 		 441 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  43.93 
 
 		 441 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 445 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  41.86 
 
 		 442 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2144  major facilitator transporter  42.73 
 
 		 437 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.129107 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  44.25 
 
 		 441 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  44.25 
 
 		 441 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  45.08 
 
 		 442 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3940  major facilitator family transporter  42.49 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.100608  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  41.28 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1431  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 		 432 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1897  major facilitator transporter  42.73 
 
 		 488 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  43.77 
 
 		 441 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 433 aa  349  7e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1381  major facilitator superfamily MFS_1  46.37 
 
 		 438 aa  348  7e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3575  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 437 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.314754  normal  0.535313 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4554  major facilitator transporter  43.55 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 442 aa  345  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 477 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  42.36 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  42.57 
 
 		 435 aa  342  7e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  40 
 
 		 445 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>