More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51300 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_51300  major facilitator superfamily (MFS) permease  100 
 
 
440 aa  868    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  70.97 
 
 
436 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  71.46 
 
 
435 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0632064 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3541  major facilitator transporter  71.46 
 
 
435 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  70.97 
 
 
466 aa  544  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0039  major facilitator transporter  64.68 
 
 
438 aa  528  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  40.32 
 
 
432 aa  319  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  42.48 
 
 
441 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  40.29 
 
 
436 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  45.09 
 
 
424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  43.16 
 
 
428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 
433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  40.85 
 
 
435 aa  306  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  41.19 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  41.43 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  43.95 
 
 
432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  43.47 
 
 
443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  40.48 
 
 
442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  40.95 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  40.95 
 
 
441 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  40.95 
 
 
441 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  42.08 
 
 
445 aa  302  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  40.78 
 
 
437 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  44.36 
 
 
439 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  40.18 
 
 
432 aa  298  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  40.85 
 
 
449 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  40.52 
 
 
437 aa  296  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  41.61 
 
 
432 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  42.72 
 
 
426 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  42.02 
 
 
442 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3490  major facilitator transporter  42.45 
 
 
435 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000252104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  37.5 
 
 
442 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  39.42 
 
 
442 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  42.08 
 
 
441 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  42.08 
 
 
441 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  44.23 
 
 
444 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  38.24 
 
 
442 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  38.42 
 
 
454 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  40.48 
 
 
440 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4332  major facilitator transporter  42.21 
 
 
435 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.206712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4034  major facilitator transporter  42.21 
 
 
435 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  39.72 
 
 
434 aa  292  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05840  tartrate transporter  41.1 
 
 
472 aa  292  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  39.57 
 
 
443 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  41.05 
 
 
436 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 
440 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  41.46 
 
 
440 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  41.77 
 
 
443 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  40.43 
 
 
440 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  40.59 
 
 
440 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  40.59 
 
 
440 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  41.34 
 
 
437 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  40.86 
 
 
433 aa  288  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 
444 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  42.39 
 
 
434 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  40.05 
 
 
432 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4906  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 
440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.291929  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  42 
 
 
458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  42.02 
 
 
440 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1075  major facilitator transporter  38.25 
 
 
474 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.561566  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  38.57 
 
 
441 aa  286  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  38.72 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  40.67 
 
 
444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  40.95 
 
 
440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  40.65 
 
 
435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 
444 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  39.07 
 
 
441 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  40.05 
 
 
451 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  36.58 
 
 
437 aa  284  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  37.84 
 
 
445 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  41.88 
 
 
440 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  41.63 
 
 
439 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  39.95 
 
 
439 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  37.7 
 
 
452 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  37.94 
 
 
439 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 
450 aa  280  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  41.69 
 
 
434 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  41.69 
 
 
434 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  41.69 
 
 
434 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  37.53 
 
 
428 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  39.25 
 
 
454 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 
429 aa  278  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.41 
 
 
439 aa  279  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  37.24 
 
 
443 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  35.68 
 
 
435 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  38.35 
 
 
433 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  43.36 
 
 
444 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  37.53 
 
 
428 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  38.8 
 
 
453 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 
440 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4554  major facilitator transporter  41.87 
 
 
435 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3501  major facilitator transporter  39.25 
 
 
435 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  39.9 
 
 
440 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  41.31 
 
 
452 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  40 
 
 
437 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  41.31 
 
 
452 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  37.5 
 
 
433 aa  276  5e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  36.69 
 
 
462 aa  275  9e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  37.44 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  42.86 
 
 
444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>