More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4906 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4906  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 440 aa  859    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.291929  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3869  major facilitator transporter  78.23 
 
 		 442 aa  655    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0325086  normal  0.681862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5091  major facilitator transporter  76.99 
 
 		 440 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.792856  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6975  major facilitator superfamily MFS_1  71.43 
 
 		 443 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0212916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4251  major facilitator transporter  71.46 
 
 		 447 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25970  Major facilitator superfamily protein  71.39 
 
 		 414 aa  574  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5023  major facilitator transporter  66.28 
 
 		 443 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1316  general substrate transporter  65.91 
 
 		 443 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1999  major facilitator transporter  50 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0211395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2562  major facilitator transporter  48.16 
 
 		 438 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.144453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  44.36 
 
 		 451 aa  363  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 437 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 437 aa  356  5.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 437 aa  355  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 445 aa  352  7e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  47.39 
 
 		 442 aa  349  6e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 		 444 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  42.58 
 
 		 433 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  42.58 
 
 		 433 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  44.13 
 
 		 441 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  44.13 
 
 		 441 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  44.24 
 
 		 441 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  44.58 
 
 		 433 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 462 aa  342  9e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 442 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 434 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 434 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 434 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 434 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 434 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  44.06 
 
 		 439 aa  338  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  43.51 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3391  tartrate MFS transporter, putative  47.17 
 
 		 438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200595  normal  0.335671 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  43.65 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0200  major facilitator family transporter  44.29 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.68 
 
 		 440 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 441 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  46.23 
 
 		 430 aa  331  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 477 aa  330  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 443 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  43.66 
 
 		 429 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 442 aa  329  6e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  41.09 
 
 		 439 aa  328  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3214  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 440 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.09 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  42.28 
 
 		 428 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 434 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 442 aa  326  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  42.55 
 
 		 441 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1636  MFS transporter  44.63 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0172  major facilitator family transporter  44.63 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0261  major facilitator superfamily permease  44.63 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  41.09 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  41.09 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  41.09 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  45.78 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.09 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  41.09 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  41.79 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  41.09 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  42.32 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 452 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 		 445 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 444 aa  320  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  42.42 
 
 		 436 aa  319  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 442 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3501  major facilitator transporter  42.25 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  41.83 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  42.08 
 
 		 433 aa  316  4e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  42.75 
 
 		 432 aa  316  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 442 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  39.9 
 
 		 469 aa  315  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  44.22 
 
 		 441 aa  316  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 437 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4964  d-galactonate transporter  40.14 
 
 		 448 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169087  normal  0.027359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2785  d-galactonate transporter  40.14 
 
 		 448 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.0710234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  41.91 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2144  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.129107 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  41.13 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3940  major facilitator family transporter  40 
 
 		 437 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.100608  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4083  major facilitator superfamily MFS_1  43.63 
 
 		 462 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 441 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>