More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2592 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  94.27 
 
 
436 aa  762    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  96.09 
 
 
435 aa  761    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0632064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  100 
 
 
466 aa  906    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3541  major facilitator transporter  96.55 
 
 
435 aa  764    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51300  major facilitator superfamily (MFS) permease  70.97 
 
 
440 aa  537  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0039  major facilitator transporter  63.38 
 
 
438 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  46.93 
 
 
428 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  47.8 
 
 
443 aa  324  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  40.33 
 
 
435 aa  323  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  41.86 
 
 
442 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  44.26 
 
 
432 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  44.92 
 
 
432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  43.65 
 
 
424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  41.97 
 
 
442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  43.88 
 
 
440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  41.8 
 
 
441 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  43.55 
 
 
432 aa  319  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  40.78 
 
 
437 aa  319  7e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  44 
 
 
432 aa  316  7e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 
433 aa  315  8e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  41.11 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  40.28 
 
 
454 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  42.62 
 
 
436 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  41.43 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  43.33 
 
 
441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  42.76 
 
 
432 aa  313  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  42.13 
 
 
436 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  41.87 
 
 
441 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  44.74 
 
 
439 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  42.79 
 
 
433 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  39.1 
 
 
442 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  40.85 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  40.85 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  42.06 
 
 
441 aa  310  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  40.96 
 
 
434 aa  309  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 
450 aa  308  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  44.24 
 
 
426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  42.15 
 
 
444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  42.4 
 
 
442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  41.52 
 
 
441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  41.52 
 
 
441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  40.61 
 
 
441 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 
452 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  41.48 
 
 
441 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  45.41 
 
 
440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  43 
 
 
440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  41.52 
 
 
441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  41.52 
 
 
441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  44.26 
 
 
440 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  47.93 
 
 
435 aa  306  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 
439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  39 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.82 
 
 
439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 
449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  44.15 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  44.15 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  41.52 
 
 
441 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  44.15 
 
 
440 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3490  major facilitator transporter  43.06 
 
 
435 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000252104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  43.84 
 
 
435 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  43.36 
 
 
456 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4332  major facilitator transporter  43.06 
 
 
435 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.206712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4034  major facilitator transporter  43.06 
 
 
435 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  41.42 
 
 
451 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  41.9 
 
 
434 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 
444 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  41.4 
 
 
452 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  40.14 
 
 
443 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  42.14 
 
 
434 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  42.65 
 
 
435 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  44.25 
 
 
437 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  40.72 
 
 
444 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  38.8 
 
 
445 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  43.97 
 
 
441 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  43.97 
 
 
441 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  46.47 
 
 
440 aa  299  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 
440 aa  299  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  42.22 
 
 
443 aa  299  9e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  42.86 
 
 
441 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  43.15 
 
 
437 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  43.74 
 
 
439 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  42.38 
 
 
434 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  43.31 
 
 
444 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  42.38 
 
 
434 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  42.07 
 
 
440 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  41.9 
 
 
434 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  42.38 
 
 
434 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  41.63 
 
 
477 aa  298  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  44.5 
 
 
440 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  40.96 
 
 
440 aa  296  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  40.23 
 
 
439 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  46.28 
 
 
439 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  40 
 
 
462 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  39.02 
 
 
433 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  40.05 
 
 
469 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  46.51 
 
 
430 aa  293  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  42.49 
 
 
444 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05840  tartrate transporter  38.73 
 
 
472 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  44.94 
 
 
430 aa  293  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 
439 aa  293  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>