More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4861 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  89.07 
 
 		 430 aa  719    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  97.3 
 
 		 444 aa  804    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  100 
 
 		 444 aa  853    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  55.14 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  49.89 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  51.39 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  52.72 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  53.51 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  53.46 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  52.39 
 
 		 433 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  51.83 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  51.49 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  49.53 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  51.52 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  54.06 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  50.47 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  47.75 
 
 		 442 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  53.43 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  53.85 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  53.57 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  48.11 
 
 		 454 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  51.74 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  47.73 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  49.52 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  55.06 
 
 		 433 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  52.89 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  51.43 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  50.35 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  46.4 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  48.48 
 
 		 424 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  51.88 
 
 		 436 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  47.82 
 
 		 440 aa  359  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  51.64 
 
 		 436 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  48.33 
 
 		 454 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  48.33 
 
 		 454 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  51.29 
 
 		 436 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  51.29 
 
 		 436 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  51.29 
 
 		 436 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  47.53 
 
 		 474 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  49.19 
 
 		 436 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  46.93 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  48.97 
 
 		 441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  47.72 
 
 		 434 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  48.97 
 
 		 441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  46.93 
 
 		 459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  46.93 
 
 		 459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  44.58 
 
 		 437 aa  352  5e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 440 aa  351  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  47.7 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  43.05 
 
 		 462 aa  349  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  46.27 
 
 		 440 aa  349  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  51.42 
 
 		 431 aa  348  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  47.79 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  48.16 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  46 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  46 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 444 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  46.73 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  45.76 
 
 		 440 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  48.28 
 
 		 436 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 434 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 434 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 434 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  50.35 
 
 		 431 aa  345  8e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  46.63 
 
 		 440 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  47.24 
 
 		 434 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  47 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  45.68 
 
 		 436 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 448 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 441 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 448 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 441 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 448 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  45.93 
 
 		 440 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 441 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  47.27 
 
 		 442 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 441 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 441 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  48.56 
 
 		 434 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  45.5 
 
 		 469 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  45.34 
 
 		 451 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 441 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  47.83 
 
 		 444 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  45.87 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  47.66 
 
 		 436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  45.87 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  45.87 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  45.87 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  47.66 
 
 		 436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  47.01 
 
 		 442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  45.87 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  47.81 
 
 		 436 aa  339  5e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 		 439 aa  339  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 441 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  41.12 
 
 		 441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>