More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4250 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  85.78 
 
 		 435 aa  687    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  100 
 
 		 440 aa  852    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  53.77 
 
 		 432 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  51.18 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  53.47 
 
 		 439 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  48.53 
 
 		 440 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  48.86 
 
 		 440 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  52.72 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  49.32 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  49.32 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 440 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  54.09 
 
 		 439 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  51.7 
 
 		 443 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  52.09 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  50.35 
 
 		 432 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  52.09 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  50.98 
 
 		 442 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  52.51 
 
 		 432 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  50.82 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  49.88 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  52.24 
 
 		 428 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0776  major facilitator transporter  51.63 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4836  major facilitator transporter  52.61 
 
 		 452 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  50 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  50.93 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  50 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  48.49 
 
 		 444 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05840  tartrate transporter  47.25 
 
 		 472 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  50.12 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  51.11 
 
 		 441 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  51.89 
 
 		 424 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  53.48 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  52.32 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  51.34 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  49.76 
 
 		 430 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  47.13 
 
 		 440 aa  359  5e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  53.65 
 
 		 433 aa  359  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  47 
 
 		 433 aa  358  8e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  49.36 
 
 		 444 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  48.91 
 
 		 440 aa  355  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  48.12 
 
 		 437 aa  355  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  48.86 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  48.98 
 
 		 444 aa  353  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  48.85 
 
 		 469 aa  353  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  48.62 
 
 		 441 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  48.61 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  44.37 
 
 		 437 aa  352  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 459 aa  352  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  48.61 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  46.88 
 
 		 469 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  48.13 
 
 		 441 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  46.24 
 
 		 437 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  48.13 
 
 		 441 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  48.59 
 
 		 441 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  48.1 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  46.88 
 
 		 440 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  46.88 
 
 		 440 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  46.88 
 
 		 440 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  46.88 
 
 		 440 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  46.88 
 
 		 440 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  44.87 
 
 		 443 aa  350  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  47.85 
 
 		 435 aa  349  5e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  48.36 
 
 		 441 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  45.57 
 
 		 439 aa  349  7e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  46.55 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  46.55 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  46.55 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  46.55 
 
 		 441 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  44.63 
 
 		 451 aa  347  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  44.15 
 
 		 445 aa  346  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  47 
 
 		 435 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  47 
 
 		 435 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  45.31 
 
 		 454 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  44.58 
 
 		 433 aa  345  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  48.38 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  46.31 
 
 		 441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  44.21 
 
 		 453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8308  major facilitator superfamily MFS_1  48.32 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  49.19 
 
 		 436 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 436 aa  343  4e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 426 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  49.19 
 
 		 436 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  49.19 
 
 		 436 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 436 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  44.65 
 
 		 449 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  45.94 
 
 		 445 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  45.8 
 
 		 435 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  45.8 
 
 		 435 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  44.6 
 
 		 433 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  45.8 
 
 		 435 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 444 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  48.39 
 
 		 436 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  47.17 
 
 		 444 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  47.64 
 
 		 442 aa  341  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  46.48 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  49.53 
 
 		 436 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>