More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3264 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  88.15 
 
 
439 aa  723    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  100 
 
 
439 aa  860    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  62.17 
 
 
435 aa  495  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  50.96 
 
 
432 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  50.35 
 
 
432 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  53.9 
 
 
450 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  48.28 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  52.59 
 
 
432 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  48.95 
 
 
428 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  52.83 
 
 
445 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  50.12 
 
 
433 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  50.58 
 
 
432 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  49.65 
 
 
443 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  47.91 
 
 
432 aa  385  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  45.54 
 
 
437 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  51.31 
 
 
443 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  46.6 
 
 
435 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  46.6 
 
 
437 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  49.07 
 
 
430 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  47.86 
 
 
441 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  50.64 
 
 
430 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  47.71 
 
 
454 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  50.5 
 
 
437 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  48.1 
 
 
441 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  48.1 
 
 
441 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  46.74 
 
 
441 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  48.1 
 
 
441 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  47.38 
 
 
441 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  48.74 
 
 
424 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  47.14 
 
 
441 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  49.61 
 
 
444 aa  363  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  45.86 
 
 
440 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  49.61 
 
 
444 aa  361  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  47.24 
 
 
444 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  46.99 
 
 
441 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  46.45 
 
 
435 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  47.1 
 
 
436 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  49.18 
 
 
431 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  46.98 
 
 
441 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  45.6 
 
 
437 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  46.36 
 
 
440 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  46.02 
 
 
469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  44.65 
 
 
440 aa  353  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  45.31 
 
 
454 aa  353  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  46.02 
 
 
440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  46.02 
 
 
440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  46.02 
 
 
440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  46.48 
 
 
440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  46.02 
 
 
440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  46.02 
 
 
440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  45.73 
 
 
437 aa  351  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  45.78 
 
 
469 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  53.39 
 
 
433 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  47.92 
 
 
436 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  45.56 
 
 
436 aa  350  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  46.64 
 
 
436 aa  349  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  48.48 
 
 
431 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  44.99 
 
 
452 aa  348  8e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  48.58 
 
 
435 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  48.58 
 
 
435 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  48.34 
 
 
435 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  48.34 
 
 
435 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  48.34 
 
 
435 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  43.74 
 
 
442 aa  346  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  46.46 
 
 
459 aa  346  6e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  45.19 
 
 
433 aa  345  7e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  43.91 
 
 
441 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  47.78 
 
 
436 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  44.08 
 
 
441 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  44.08 
 
 
441 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  45.52 
 
 
439 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  43.68 
 
 
441 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  44.26 
 
 
440 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  43.91 
 
 
441 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  44.26 
 
 
440 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  43.91 
 
 
441 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  44.5 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  44.37 
 
 
449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  45.65 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  43.74 
 
 
443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  47.54 
 
 
436 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  47.54 
 
 
436 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  47.54 
 
 
436 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  46.81 
 
 
434 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  44.94 
 
 
439 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.18 
 
 
439 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  44.88 
 
 
436 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  43.68 
 
 
441 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  44.52 
 
 
462 aa  340  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  44.47 
 
 
445 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  42.89 
 
 
440 aa  338  9e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  43.47 
 
 
442 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  46.1 
 
 
434 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 
433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  42.28 
 
 
436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  43.94 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  46.37 
 
 
441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  44.34 
 
 
444 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  45.37 
 
 
435 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  43.72 
 
 
444 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>