More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_05840 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_05840  tartrate transporter  100 
 
 
472 aa  954    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0776  major facilitator transporter  68.55 
 
 
439 aa  569  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4836  major facilitator transporter  69.65 
 
 
452 aa  554  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  51.14 
 
 
440 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  48.4 
 
 
440 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  51.23 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  48.5 
 
 
440 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  48.63 
 
 
440 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  48.17 
 
 
440 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  51.23 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 
444 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  48.17 
 
 
440 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  51.21 
 
 
439 aa  415  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  49.88 
 
 
439 aa  398  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  47.25 
 
 
440 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  47.14 
 
 
435 aa  364  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  44.47 
 
 
428 aa  363  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  45.79 
 
 
432 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  45.01 
 
 
432 aa  356  5e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  46.81 
 
 
432 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  42.73 
 
 
432 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  45.37 
 
 
432 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  42.08 
 
 
443 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  42.55 
 
 
433 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  42.95 
 
 
450 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  42.86 
 
 
445 aa  332  9e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  44.78 
 
 
444 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 
430 aa  330  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  42.13 
 
 
442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  43.39 
 
 
430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  42.12 
 
 
433 aa  327  3e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  43.77 
 
 
444 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  45.48 
 
 
443 aa  324  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  39.72 
 
 
459 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  42.61 
 
 
453 aa  322  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  41.24 
 
 
441 aa  322  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  41.11 
 
 
441 aa  320  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  40.47 
 
 
444 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  42.06 
 
 
441 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42.96 
 
 
441 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42.96 
 
 
441 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  42.96 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  45.5 
 
 
437 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  42.64 
 
 
444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  41.69 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  40.23 
 
 
454 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  40.23 
 
 
435 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  40.23 
 
 
435 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  42.24 
 
 
441 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.34 
 
 
441 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  45.22 
 
 
433 aa  312  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  40.46 
 
 
435 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  40.46 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  40 
 
 
435 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  41.58 
 
 
459 aa  309  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  43.06 
 
 
469 aa  309  8e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  43.06 
 
 
440 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  43.06 
 
 
440 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  43.06 
 
 
440 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  42.82 
 
 
469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  43.06 
 
 
440 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  42.65 
 
 
443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  43.06 
 
 
440 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  40.91 
 
 
474 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  39.31 
 
 
437 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  38.55 
 
 
437 aa  306  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  42.73 
 
 
431 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  39.63 
 
 
462 aa  305  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 
440 aa  305  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  40.09 
 
 
459 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  40.09 
 
 
459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  40.09 
 
 
459 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  40.09 
 
 
433 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  43.82 
 
 
436 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  38.41 
 
 
454 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  38.41 
 
 
454 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  38.98 
 
 
466 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  39.76 
 
 
439 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  39.27 
 
 
445 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  39.76 
 
 
435 aa  299  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  43.59 
 
 
436 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  42.89 
 
 
436 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 
424 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  43.12 
 
 
436 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  42.17 
 
 
435 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  43.59 
 
 
436 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  43.59 
 
 
436 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  43.59 
 
 
436 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  40 
 
 
436 aa  296  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  41.8 
 
 
431 aa  296  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  40.19 
 
 
454 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  40.73 
 
 
435 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0632064 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3541  major facilitator transporter  40.29 
 
 
435 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  37.76 
 
 
442 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  39.63 
 
 
440 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  42.86 
 
 
436 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51300  major facilitator superfamily (MFS) permease  41.22 
 
 
440 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.43 
 
 
439 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  39.72 
 
 
441 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  39.53 
 
 
441 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>