More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4880 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  81.67 
 
 		 441 aa  682    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  100 
 
 		 440 aa  883    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  91.36 
 
 		 440 aa  815    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  81.67 
 
 		 441 aa  682    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  95 
 
 		 440 aa  846    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  98.64 
 
 		 440 aa  876    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  98.64 
 
 		 440 aa  876    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  59.24 
 
 		 440 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  58.27 
 
 		 444 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  59.02 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  59.67 
 
 		 439 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  48.86 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  49.4 
 
 		 432 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  49.66 
 
 		 432 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  48.13 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05840  tartrate transporter  48.4 
 
 		 472 aa  395  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4836  major facilitator transporter  50.23 
 
 		 452 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  48.5 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  49.41 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0776  major facilitator transporter  49.17 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  46.12 
 
 		 433 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  50.51 
 
 		 437 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  44.88 
 
 		 443 aa  362  6e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  46.31 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 454 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  43.42 
 
 		 442 aa  354  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 		 430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  47.8 
 
 		 444 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 428 aa  348  9e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  42.25 
 
 		 444 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 441 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  43.84 
 
 		 444 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  44.6 
 
 		 450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 444 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 441 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  45.75 
 
 		 432 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  44.89 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  44.75 
 
 		 439 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  43.53 
 
 		 451 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  43.84 
 
 		 430 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  43.11 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  41.38 
 
 		 453 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  41.87 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  43.38 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  41.87 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 443 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  45.9 
 
 		 436 aa  323  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 426 aa  323  5e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  46.64 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 443 aa  319  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 474 aa  319  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 436 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  43.38 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  43.38 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  40 
 
 		 459 aa  316  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 436 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  44.76 
 
 		 431 aa  315  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  44.62 
 
 		 443 aa  315  9e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  42.34 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  42.11 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  42.01 
 
 		 454 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 459 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 433 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 459 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 459 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  42.01 
 
 		 469 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  42.01 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  42.01 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  39.41 
 
 		 436 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  44.66 
 
 		 431 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  42.01 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.01 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  42.01 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.77 
 
 		 469 aa  310  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 445 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  43.6 
 
 		 439 aa  310  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 445 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  43.8 
 
 		 424 aa  309  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  43 
 
 		 439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>