More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6712 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  78.84 
 
 		 452 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  100 
 
 		 449 aa  884    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  79.06 
 
 		 452 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  82.66 
 
 		 458 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3079  major facilitator transporter  72.31 
 
 		 457 aa  559  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  58.63 
 
 		 435 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  58.31 
 
 		 435 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  57.08 
 
 		 437 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  57.59 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  56.6 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  46.51 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  45.77 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 462 aa  362  7.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  46.1 
 
 		 432 aa  362  9e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  42.96 
 
 		 432 aa  355  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  45.58 
 
 		 431 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 443 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  43.19 
 
 		 442 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 441 aa  349  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  46.75 
 
 		 432 aa  346  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  46.73 
 
 		 445 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 459 aa  335  9e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2075  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  43.35 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  43.88 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 		 440 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.12 
 
 		 439 aa  333  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 443 aa  332  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 439 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  44.65 
 
 		 440 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  42.14 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 434 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  43.23 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  43.34 
 
 		 443 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  43.17 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 434 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 434 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 434 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  42 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  45.14 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 		 424 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.61 
 
 		 441 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 433 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  43.45 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  41.22 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  41.22 
 
 		 440 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  41.22 
 
 		 440 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.22 
 
 		 469 aa  319  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.22 
 
 		 440 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  41.22 
 
 		 440 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  41.22 
 
 		 440 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  43.61 
 
 		 445 aa  319  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  42.02 
 
 		 440 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  43.87 
 
 		 450 aa  318  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  45.1 
 
 		 442 aa  318  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  45.14 
 
 		 477 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 452 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1472  major facilitator transporter  45.79 
 
 		 448 aa  318  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137631 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  45.53 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  42.54 
 
 		 451 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 436 aa  316  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  40.79 
 
 		 433 aa  316  5e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 454 aa  316  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  40.63 
 
 		 443 aa  316  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 440 aa  315  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  40.97 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  44.88 
 
 		 430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  40.56 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  40 
 
 		 445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 434 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 436 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 434 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  42.18 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 436 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 430 aa  309  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 441 aa  308  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>