More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2313 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  100 
 
 		 440 aa  871    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  95.68 
 
 		 440 aa  800    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  43.86 
 
 		 433 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 436 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  45.58 
 
 		 432 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  44.31 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 442 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  46.27 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  44.6 
 
 		 432 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  41.27 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  41.15 
 
 		 433 aa  328  9e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  42.02 
 
 		 449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  43.86 
 
 		 432 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 		 444 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  41.37 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  44.13 
 
 		 444 aa  322  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 428 aa  322  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  45.25 
 
 		 439 aa  322  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  42.25 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 		 424 aa  319  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  42.99 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  41.69 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  42.61 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 440 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 459 aa  315  9e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  42.18 
 
 		 453 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  44.86 
 
 		 437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 440 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  42.02 
 
 		 449 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 437 aa  312  9e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  39.26 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  42.25 
 
 		 445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 439 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 466 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  43.25 
 
 		 439 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 435 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 434 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 443 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  40.68 
 
 		 437 aa  305  8.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  42.37 
 
 		 434 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  38.88 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.66 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3541  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0632064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0353  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 428 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0374  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 444 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0364  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305692  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 434 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 434 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 434 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  43.63 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 439 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 441 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 433 aa  299  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 428 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 437 aa  298  9e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  37.89 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 458 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  37.89 
 
 		 433 aa  298  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 441 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 441 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 441 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 437 aa  296  5e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  42.41 
 
 		 435 aa  296  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 439 aa  295  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  42.28 
 
 		 441 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 441 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  42.28 
 
 		 441 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 435 aa  295  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1999  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 443 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0211395  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  39.71 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  39.71 
 
 		 440 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  39.71 
 
 		 440 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  39.71 
 
 		 440 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>