More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0364 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0364  major facilitator transporter  100 
 
 
428 aa  830    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0353  major facilitator transporter  99.53 
 
 
428 aa  828    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00469772  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0374  major facilitator transporter  100 
 
 
428 aa  830    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2646  major facilitator superfamily MFS_1  49.18 
 
 
453 aa  411  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2926  major facilitator transporter  51.33 
 
 
446 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2422  major facilitator superfamily MFS_1  51.42 
 
 
450 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  45.16 
 
 
442 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  46.81 
 
 
443 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  44.71 
 
 
432 aa  346  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  46.11 
 
 
430 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  42.17 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  44.34 
 
 
459 aa  335  9e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  45.85 
 
 
444 aa  333  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  45.6 
 
 
444 aa  329  6e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  43.66 
 
 
433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  44.15 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  43.2 
 
 
437 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  44.04 
 
 
435 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  44.04 
 
 
435 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  42.86 
 
 
432 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  45.04 
 
 
433 aa  323  4e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  44.04 
 
 
435 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  44.04 
 
 
435 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  47.81 
 
 
443 aa  322  6e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  44.72 
 
 
441 aa  322  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  43.55 
 
 
436 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  43.8 
 
 
435 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  43.55 
 
 
436 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  43.49 
 
 
450 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  43.81 
 
 
428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  43.55 
 
 
436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  43.37 
 
 
444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  43.21 
 
 
469 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  42.72 
 
 
469 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  42.72 
 
 
440 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  42.72 
 
 
440 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.72 
 
 
440 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  42.72 
 
 
440 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  42.72 
 
 
440 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  43.49 
 
 
424 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  41.43 
 
 
436 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 
444 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  43.46 
 
 
441 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  42.96 
 
 
434 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  42.72 
 
 
434 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  44.1 
 
 
444 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  40.33 
 
 
455 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  42.72 
 
 
434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  43.81 
 
 
453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  41.63 
 
 
454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  41.18 
 
 
437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  41.57 
 
 
445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  42.15 
 
 
432 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  43.2 
 
 
442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  42.48 
 
 
436 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  41.98 
 
 
434 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  41.98 
 
 
434 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  41.98 
 
 
434 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  43.1 
 
 
432 aa  308  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  42.18 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  43.85 
 
 
439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  43.86 
 
 
444 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  43.69 
 
 
437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  41.73 
 
 
441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  41.73 
 
 
441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  44.26 
 
 
432 aa  306  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  41.73 
 
 
441 aa  306  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  41.48 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  41.23 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  41.48 
 
 
441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  41.48 
 
 
441 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.49 
 
 
439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 
439 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 
440 aa  302  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  42.75 
 
 
431 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  39.01 
 
 
440 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  44.37 
 
 
435 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  46.17 
 
 
437 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.23 
 
 
443 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  43.42 
 
 
435 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  42.68 
 
 
434 aa  298  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  36.96 
 
 
441 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  40.74 
 
 
445 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  44.5 
 
 
440 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 
440 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  39.71 
 
 
440 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  44.03 
 
 
440 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  39.42 
 
 
440 aa  295  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  39.81 
 
 
440 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  39.81 
 
 
440 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  45.27 
 
 
440 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  37.44 
 
 
441 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  39.13 
 
 
454 aa  294  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  39.23 
 
 
434 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  39 
 
 
452 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  40.68 
 
 
433 aa  293  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  38.76 
 
 
451 aa  293  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  39.09 
 
 
440 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  39.33 
 
 
440 aa  292  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  42.37 
 
 
455 aa  292  8e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>