More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3771 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  100 
 
 		 435 aa  861    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  98.16 
 
 		 437 aa  850    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  94.94 
 
 		 440 aa  785    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  78.62 
 
 		 435 aa  680    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  78.01 
 
 		 433 aa  615  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  58.31 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  57.42 
 
 		 452 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  57.18 
 
 		 452 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  55.74 
 
 		 458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3079  major facilitator transporter  54.93 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  48.17 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 428 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  47.26 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  42.52 
 
 		 432 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  46.34 
 
 		 431 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 442 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  50.79 
 
 		 443 aa  363  4e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  43.66 
 
 		 432 aa  362  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  43.6 
 
 		 432 aa  362  6e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  45.71 
 
 		 433 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  46.51 
 
 		 430 aa  359  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  47.38 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  45.13 
 
 		 459 aa  356  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  43.66 
 
 		 450 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  47.38 
 
 		 430 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  45.58 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 		 440 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  45.66 
 
 		 424 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 440 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  44.8 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  45.11 
 
 		 443 aa  340  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  45.15 
 
 		 439 aa  339  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  46.23 
 
 		 430 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  47.24 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 444 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  46.63 
 
 		 445 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  44.69 
 
 		 440 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  44.72 
 
 		 445 aa  332  8e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 436 aa  332  8e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  39.86 
 
 		 455 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  39.49 
 
 		 450 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 		 444 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  45.34 
 
 		 444 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 437 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 442 aa  330  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  42.68 
 
 		 451 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 436 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 436 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  46.56 
 
 		 433 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 450 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  44.09 
 
 		 433 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  42 
 
 		 441 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 454 aa  329  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  45.04 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 		 433 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 464 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1472  major facilitator transporter  48.93 
 
 		 448 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  42.57 
 
 		 439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 444 aa  326  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 442 aa  326  6e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  42 
 
 		 441 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  44.85 
 
 		 442 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  42.44 
 
 		 434 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 454 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  45.37 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  43.33 
 
 		 430 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 439 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 454 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  44.03 
 
 		 437 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  42.3 
 
 		 439 aa  323  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  44.07 
 
 		 435 aa  323  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 441 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.82 
 
 		 439 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 441 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 441 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 440 aa  322  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  41.81 
 
 		 447 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 441 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  39.61 
 
 		 436 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 434 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>