More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4867 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  91.08 
 
 
441 aa  734    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  100 
 
 
445 aa  871    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  64.4 
 
 
435 aa  552  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1472  major facilitator transporter  72.92 
 
 
448 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2075  major facilitator transporter  67.98 
 
 
435 aa  515  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  63.29 
 
 
430 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  62.65 
 
 
431 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  62.41 
 
 
430 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  52.29 
 
 
441 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5327  major facilitator transporter  51.71 
 
 
436 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3497  major facilitator transporter  52.25 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.61978  hitchhiker  0.00838162 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5094  major facilitator transporter  53.16 
 
 
436 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0811378  normal  0.190217 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2524  major facilitator transporter  51.46 
 
 
436 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3929  major facilitator transporter  51.72 
 
 
436 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3591  major facilitator transporter  51.72 
 
 
436 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163155  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  46.15 
 
 
435 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  45.79 
 
 
437 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  45.62 
 
 
440 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  46.44 
 
 
449 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7147  major facilitator superfamily MFS_1  52.12 
 
 
435 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.604995 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  47.25 
 
 
452 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  44.44 
 
 
432 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  47.02 
 
 
452 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1097  major facilitator family transporter  55.16 
 
 
431 aa  355  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0387869  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  48.79 
 
 
458 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  44.88 
 
 
435 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  45.82 
 
 
439 aa  352  7e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  44.58 
 
 
432 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  45.24 
 
 
439 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0215  major facilitator family transporter  55.5 
 
 
751 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25421  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0348  major facilitator family transporter  55.45 
 
 
431 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1389  major facilitator family transporter  55.5 
 
 
751 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1799  major facilitator family transporter  55.45 
 
 
431 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118328  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0950  major facilitator family transporter  55.5 
 
 
751 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.601633  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.24 
 
 
439 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0430  major facilitator family transporter  55.5 
 
 
797 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1884  major facilitator family transporter  55.21 
 
 
431 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530062  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3079  major facilitator transporter  47.7 
 
 
457 aa  343  4e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  47.1 
 
 
434 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  47.91 
 
 
437 aa  343  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  46.14 
 
 
428 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  47.58 
 
 
434 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  47.58 
 
 
434 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  47.43 
 
 
445 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  51.17 
 
 
443 aa  342  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  47.58 
 
 
434 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5189  major facilitator transporter  54.88 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.593783  normal  0.0498797 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  47.34 
 
 
434 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  47.1 
 
 
434 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  42.21 
 
 
442 aa  336  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  46.85 
 
 
436 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  44.32 
 
 
432 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  43.31 
 
 
433 aa  333  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  47.34 
 
 
434 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  41.94 
 
 
462 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  43.08 
 
 
445 aa  331  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  47 
 
 
442 aa  330  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 
450 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  40.97 
 
 
432 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  46.92 
 
 
435 aa  329  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  46.24 
 
 
444 aa  329  7e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  46.58 
 
 
432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  45.08 
 
 
440 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  45.67 
 
 
444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  42.49 
 
 
459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  47.39 
 
 
435 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  47.51 
 
 
435 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  42.26 
 
 
454 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  47.27 
 
 
435 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  47.51 
 
 
435 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  41.81 
 
 
437 aa  324  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  47.51 
 
 
435 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  47.51 
 
 
435 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  47.51 
 
 
435 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  42.29 
 
 
451 aa  323  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  42.82 
 
 
443 aa  322  7e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 
452 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  45.92 
 
 
440 aa  322  8e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  45.28 
 
 
433 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  45.03 
 
 
440 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  47.49 
 
 
433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  42.63 
 
 
449 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  41.44 
 
 
433 aa  319  5e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  45.56 
 
 
444 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  45.7 
 
 
456 aa  319  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  46.96 
 
 
435 aa  318  9e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  42.42 
 
 
435 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  43.11 
 
 
440 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  42.33 
 
 
442 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 
430 aa  316  4e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  41.82 
 
 
442 aa  317  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  43.44 
 
 
441 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  43.44 
 
 
441 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  41.97 
 
 
437 aa  316  5e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  41.67 
 
 
440 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  41.67 
 
 
440 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  41.04 
 
 
442 aa  316  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  44.61 
 
 
439 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5738  major facilitator superfamily MFS_1  42.33 
 
 
445 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  44.95 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>