More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5738 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5738  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
445 aa  870    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  51.07 
 
 
441 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5327  major facilitator transporter  50.23 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3497  major facilitator transporter  50 
 
 
436 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.61978  hitchhiker  0.00838162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2524  major facilitator transporter  49.77 
 
 
436 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5094  major facilitator transporter  50.12 
 
 
436 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0811378  normal  0.190217 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7147  major facilitator superfamily MFS_1  51.66 
 
 
435 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.604995 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3929  major facilitator transporter  49.64 
 
 
436 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3591  major facilitator transporter  49.64 
 
 
436 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163155  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1097  major facilitator family transporter  52.94 
 
 
431 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0387869  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  45.37 
 
 
435 aa  341  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5189  major facilitator transporter  51.56 
 
 
435 aa  335  9e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.593783  normal  0.0498797 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0348  major facilitator family transporter  50.79 
 
 
431 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1799  major facilitator family transporter  50.79 
 
 
431 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118328  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1884  major facilitator family transporter  51.02 
 
 
431 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530062  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0215  major facilitator family transporter  51.03 
 
 
751 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25421  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1389  major facilitator family transporter  51.03 
 
 
751 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0430  major facilitator family transporter  51.03 
 
 
797 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0950  major facilitator family transporter  51.03 
 
 
751 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.601633  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  43.7 
 
 
430 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  44.2 
 
 
430 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  43.06 
 
 
431 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  43.67 
 
 
441 aa  294  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2075  major facilitator transporter  43.45 
 
 
435 aa  289  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  43.32 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  39.52 
 
 
449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1472  major facilitator transporter  43.44 
 
 
448 aa  266  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  36.9 
 
 
441 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  36.67 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  34.82 
 
 
437 aa  253  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  36.9 
 
 
441 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  36.9 
 
 
441 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  36.67 
 
 
441 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  36.67 
 
 
441 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  36.97 
 
 
437 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  35.87 
 
 
432 aa  253  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  36.43 
 
 
441 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  37.22 
 
 
435 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  36.51 
 
 
454 aa  250  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 
444 aa  249  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  35.82 
 
 
448 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  35.82 
 
 
448 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  37.14 
 
 
443 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  35.82 
 
 
448 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  37.38 
 
 
452 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  37.8 
 
 
458 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  36.03 
 
 
452 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  38.5 
 
 
433 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  38.35 
 
 
444 aa  247  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  36.67 
 
 
469 aa  245  9e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  36.67 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  36.67 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  36.67 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 
430 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  35.93 
 
 
437 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  36.67 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  37.14 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  36.67 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  36.43 
 
 
469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  38.5 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  39.14 
 
 
440 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  35.81 
 
 
432 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  36.92 
 
 
440 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 
445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  34.42 
 
 
462 aa  243  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1316  general substrate transporter  36.43 
 
 
443 aa  243  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4302  major facilitator transporter  38.93 
 
 
449 aa  242  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392665  normal  0.708279 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0341  major facilitator transporter  36.61 
 
 
453 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  36.69 
 
 
439 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 
444 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4062  major facilitator transporter  38.46 
 
 
456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 
440 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4304  major facilitator transporter  38.46 
 
 
456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  35.35 
 
 
443 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  35.53 
 
 
439 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1710  major facilitator transporter  35.88 
 
 
449 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  36.12 
 
 
440 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  33.33 
 
 
437 aa  239  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  36.05 
 
 
434 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  35.51 
 
 
434 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  35.51 
 
 
434 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  37.69 
 
 
450 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  35.51 
 
 
434 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  35.71 
 
 
434 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  35.6 
 
 
433 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 
432 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  35.42 
 
 
434 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  36.04 
 
 
442 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  34.74 
 
 
436 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  34.74 
 
 
436 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  34.74 
 
 
436 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 
444 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  36.45 
 
 
445 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  34.69 
 
 
456 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  38.25 
 
 
444 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  36.74 
 
 
442 aa  236  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  35.39 
 
 
434 aa  236  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  35.75 
 
 
441 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  35.75 
 
 
441 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  35.05 
 
 
434 aa  236  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>