More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1444 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
432 aa  855    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  58.08 
 
 
432 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  58.87 
 
 
432 aa  475  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  54.59 
 
 
432 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  55.32 
 
 
432 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  54.48 
 
 
433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  55.86 
 
 
437 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  53.55 
 
 
430 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  54.31 
 
 
444 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  51.38 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  54.06 
 
 
444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  52.59 
 
 
439 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  49.53 
 
 
440 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  50.23 
 
 
428 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  51.1 
 
 
439 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  49.54 
 
 
436 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  51.36 
 
 
444 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  51.16 
 
 
436 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 
440 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  48.92 
 
 
444 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  51.47 
 
 
454 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  51.9 
 
 
436 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  52.67 
 
 
436 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  52.67 
 
 
436 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  52.67 
 
 
436 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  50.74 
 
 
450 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  50.12 
 
 
441 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  49.13 
 
 
439 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 
439 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  51.9 
 
 
436 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  47.62 
 
 
442 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  51.14 
 
 
424 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  53.42 
 
 
443 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  51.52 
 
 
436 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  50.13 
 
 
441 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  48.69 
 
 
434 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.72 
 
 
439 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  47.73 
 
 
437 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  48.55 
 
 
459 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  50.7 
 
 
431 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  46.86 
 
 
437 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  48.33 
 
 
436 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  50 
 
 
440 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  47.24 
 
 
439 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  47.29 
 
 
426 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  48.44 
 
 
444 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  48.89 
 
 
445 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  49.21 
 
 
435 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  48.4 
 
 
443 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  49.88 
 
 
431 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  48.21 
 
 
435 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  48.69 
 
 
434 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  47.74 
 
 
434 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  48.69 
 
 
434 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  48.69 
 
 
434 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  47.74 
 
 
434 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  47.3 
 
 
440 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  47.95 
 
 
442 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  47.6 
 
 
453 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  47.3 
 
 
469 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  47.3 
 
 
440 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  47.3 
 
 
440 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  50.25 
 
 
439 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  47.3 
 
 
440 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  47.55 
 
 
441 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  45.07 
 
 
440 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  47.3 
 
 
440 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  48.44 
 
 
444 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  47.1 
 
 
441 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  47.06 
 
 
441 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  47.1 
 
 
441 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  49.18 
 
 
430 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  48.35 
 
 
441 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  46.86 
 
 
441 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  48.35 
 
 
441 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  45.93 
 
 
437 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  47.98 
 
 
434 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  46.94 
 
 
441 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  46.81 
 
 
441 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  48.09 
 
 
433 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  48.79 
 
 
459 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  46.31 
 
 
469 aa  365  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  46.08 
 
 
444 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  48.79 
 
 
459 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  45.45 
 
 
440 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  45.45 
 
 
440 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  49.03 
 
 
474 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  44.84 
 
 
437 aa  362  5.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  48.55 
 
 
459 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  45.22 
 
 
440 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  45.65 
 
 
440 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  45.82 
 
 
435 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  45.41 
 
 
445 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  46.57 
 
 
435 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  46.57 
 
 
435 aa  359  7e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  47.16 
 
 
440 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  45.35 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  46.94 
 
 
440 aa  356  5e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  45.86 
 
 
435 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  45.86 
 
 
435 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>