More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3591 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3929  major facilitator transporter  99.54 
 
 
436 aa  859    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2524  major facilitator transporter  96.79 
 
 
436 aa  801    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5094  major facilitator transporter  94.04 
 
 
436 aa  771    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0811378  normal  0.190217 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3497  major facilitator transporter  96.79 
 
 
436 aa  825    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.61978  hitchhiker  0.00838162 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5327  major facilitator transporter  97.02 
 
 
436 aa  829    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3591  major facilitator transporter  100 
 
 
436 aa  862    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163155  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7147  major facilitator superfamily MFS_1  70.53 
 
 
435 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.604995 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1097  major facilitator family transporter  69.14 
 
 
431 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0387869  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0348  major facilitator family transporter  69.27 
 
 
431 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1799  major facilitator family transporter  69.27 
 
 
431 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118328  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0950  major facilitator family transporter  69.27 
 
 
751 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.601633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1884  major facilitator family transporter  69.27 
 
 
431 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530062  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0430  major facilitator family transporter  70.02 
 
 
797 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5189  major facilitator transporter  68.59 
 
 
435 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.593783  normal  0.0498797 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0215  major facilitator family transporter  69.78 
 
 
751 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25421  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1389  major facilitator family transporter  69.78 
 
 
751 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  52.3 
 
 
441 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5738  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 
445 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  50.63 
 
 
430 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  51.39 
 
 
430 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  48.03 
 
 
435 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  47.92 
 
 
431 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  50.99 
 
 
445 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 
441 aa  358  7e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2075  major facilitator transporter  48.94 
 
 
435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1472  major facilitator transporter  50.39 
 
 
448 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137631 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  44.13 
 
 
449 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  42.32 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  41.31 
 
 
437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  41.37 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  40.24 
 
 
434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  42.07 
 
 
440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  40.25 
 
 
437 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  39.53 
 
 
441 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  38.76 
 
 
441 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  39.34 
 
 
441 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  40.91 
 
 
442 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 
442 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  39.29 
 
 
441 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  39.29 
 
 
441 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  42.22 
 
 
434 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  42.22 
 
 
434 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  42.22 
 
 
434 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.13 
 
 
442 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  39.29 
 
 
441 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  42.07 
 
 
434 aa  289  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  40.92 
 
 
458 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  42.78 
 
 
434 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  41.58 
 
 
434 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  40.99 
 
 
439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  40.83 
 
 
452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  41.09 
 
 
452 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  41.9 
 
 
436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.49 
 
 
439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 
439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  38.1 
 
 
441 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 
445 aa  282  9e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  38.34 
 
 
454 aa  282  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 
432 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  39.14 
 
 
443 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  38.39 
 
 
469 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  38.39 
 
 
440 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  42.05 
 
 
436 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  38.39 
 
 
440 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  38.39 
 
 
440 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  38.39 
 
 
440 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  38.39 
 
 
440 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  37.25 
 
 
437 aa  279  7e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  37.69 
 
 
432 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  38.5 
 
 
443 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  37.38 
 
 
436 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  37.38 
 
 
436 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  37.91 
 
 
469 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  40.51 
 
 
443 aa  277  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  37.38 
 
 
436 aa  276  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  39.95 
 
 
437 aa  276  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  40.67 
 
 
440 aa  275  8e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  42.93 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  42.08 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 
444 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  40.61 
 
 
433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  37.44 
 
 
462 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  37.35 
 
 
459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  39.32 
 
 
432 aa  273  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  38.12 
 
 
444 aa  272  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  38.46 
 
 
437 aa  272  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  40.9 
 
 
439 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 
444 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  38.82 
 
 
433 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  36.59 
 
 
450 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  38.54 
 
 
442 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  42.35 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3079  major facilitator transporter  41.07 
 
 
457 aa  270  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  39.9 
 
 
441 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  36.94 
 
 
445 aa  269  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  38.12 
 
 
451 aa  269  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  38.44 
 
 
428 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  37.78 
 
 
448 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  37.78 
 
 
448 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  36.34 
 
 
450 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>