More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2874 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  100 
 
 
435 aa  865    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  68.63 
 
 
431 aa  574  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  67.91 
 
 
430 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  67.99 
 
 
430 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  67.15 
 
 
441 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  64.98 
 
 
445 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2075  major facilitator transporter  60.14 
 
 
435 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1472  major facilitator transporter  60.93 
 
 
448 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  52.15 
 
 
441 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5327  major facilitator transporter  48.03 
 
 
436 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  45.5 
 
 
432 aa  363  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3497  major facilitator transporter  47.78 
 
 
436 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.61978  hitchhiker  0.00838162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  44.93 
 
 
442 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2524  major facilitator transporter  48.28 
 
 
436 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  44.76 
 
 
435 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  44.72 
 
 
437 aa  359  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  43.29 
 
 
432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  46.68 
 
 
437 aa  356  5.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  44.83 
 
 
435 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  46.68 
 
 
436 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  44.52 
 
 
440 aa  352  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  44.71 
 
 
449 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3542  major facilitator transporter  66.18 
 
 
306 aa  351  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  45.48 
 
 
439 aa  349  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  47.86 
 
 
442 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  47.83 
 
 
444 aa  348  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5094  major facilitator transporter  47.78 
 
 
436 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0811378  normal  0.190217 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  47.51 
 
 
444 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  44.94 
 
 
443 aa  342  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  45.17 
 
 
439 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.41 
 
 
439 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  45.37 
 
 
434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  42.96 
 
 
433 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  43.69 
 
 
428 aa  339  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  44.08 
 
 
458 aa  338  9e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  45.13 
 
 
434 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7147  major facilitator superfamily MFS_1  46.93 
 
 
435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.604995 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  44.71 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  42.3 
 
 
437 aa  335  7.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  44.71 
 
 
434 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  44.71 
 
 
434 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  44.89 
 
 
434 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  44.71 
 
 
434 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3929  major facilitator transporter  48.03 
 
 
436 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  43.13 
 
 
452 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3591  major facilitator transporter  48.03 
 
 
436 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163155  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  43.13 
 
 
452 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  41.88 
 
 
432 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 
432 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.64 
 
 
441 aa  330  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  42.57 
 
 
441 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  45.19 
 
 
435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  42.33 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  42.33 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42.57 
 
 
441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  41.29 
 
 
442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3079  major facilitator transporter  44.13 
 
 
457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42.57 
 
 
441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 
445 aa  327  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5738  major facilitator superfamily MFS_1  45.37 
 
 
445 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 
440 aa  326  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  42.57 
 
 
441 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  41.83 
 
 
469 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.83 
 
 
469 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.83 
 
 
440 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  41.83 
 
 
440 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  41.83 
 
 
440 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  41.83 
 
 
440 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  41.83 
 
 
440 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  41.73 
 
 
454 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  45.77 
 
 
445 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 
430 aa  323  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  43.48 
 
 
440 aa  322  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  45.43 
 
 
435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  45.43 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  43.04 
 
 
444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  43 
 
 
451 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  45.43 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  45.43 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  45.43 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  45.19 
 
 
435 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  45.43 
 
 
435 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  44.05 
 
 
437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 
449 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  43.04 
 
 
444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  41.79 
 
 
445 aa  319  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  42.43 
 
 
443 aa  319  7e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  45.94 
 
 
433 aa  319  7e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  40.68 
 
 
437 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  44.78 
 
 
439 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  42.19 
 
 
432 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  40.1 
 
 
442 aa  316  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 
424 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  40.28 
 
 
454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1097  major facilitator family transporter  49.28 
 
 
431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0387869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  40.48 
 
 
452 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  40.19 
 
 
441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  40.68 
 
 
443 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  40.19 
 
 
441 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  42.21 
 
 
433 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>