More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3542 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3542  major facilitator transporter  100 
 
 		 306 aa  612  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  71.32 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  70.59 
 
 		 430 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  62.75 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  66.18 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2075  major facilitator transporter  59.93 
 
 		 435 aa  298  8e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  59.92 
 
 		 441 aa  291  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  53.56 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  53.43 
 
 		 435 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  60.23 
 
 		 445 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5327  major facilitator transporter  47.88 
 
 		 436 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  49.82 
 
 		 435 aa  271  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  49.46 
 
 		 440 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2524  major facilitator transporter  49.44 
 
 		 436 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3497  major facilitator transporter  47.56 
 
 		 436 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.61978  hitchhiker  0.00838162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  49.46 
 
 		 437 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5094  major facilitator transporter  49.44 
 
 		 436 aa  268  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0811378  normal  0.190217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  52.55 
 
 		 445 aa  266  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  47.78 
 
 		 428 aa  262  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  45.82 
 
 		 433 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  48.54 
 
 		 442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  47.51 
 
 		 432 aa  255  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1097  major facilitator family transporter  51.65 
 
 		 431 aa  255  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0387869  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  49.82 
 
 		 458 aa  254  9e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  46.72 
 
 		 437 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  50.6 
 
 		 443 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0348  major facilitator family transporter  50.92 
 
 		 431 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1799  major facilitator family transporter  50.92 
 
 		 431 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118328  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1389  major facilitator family transporter  52.67 
 
 		 751 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  48 
 
 		 449 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0950  major facilitator family transporter  52.67 
 
 		 751 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.601633  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 446 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1884  major facilitator family transporter  50.92 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530062  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0215  major facilitator family transporter  52.67 
 
 		 751 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25421  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0430  major facilitator family transporter  52.67 
 
 		 797 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 436 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  43.17 
 
 		 432 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 		 424 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  45.74 
 
 		 450 aa  248  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  46.18 
 
 		 454 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  49.81 
 
 		 452 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  44.8 
 
 		 462 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3079  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 457 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  49.81 
 
 		 452 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  45.26 
 
 		 444 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  44.65 
 
 		 432 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1472  major facilitator transporter  56.52 
 
 		 448 aa  245  8e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 439 aa  244  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  44.93 
 
 		 440 aa  244  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  46.84 
 
 		 443 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  42.49 
 
 		 434 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3929  major facilitator transporter  48.21 
 
 		 436 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  43.7 
 
 		 439 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  44.67 
 
 		 456 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3591  major facilitator transporter  47.88 
 
 		 436 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  44.77 
 
 		 434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  42.37 
 
 		 459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  44.89 
 
 		 435 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  44.77 
 
 		 433 aa  242  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  44.89 
 
 		 435 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  47.01 
 
 		 452 aa  242  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  44.89 
 
 		 435 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 434 aa  242  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  44.89 
 
 		 435 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  44.89 
 
 		 435 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  45.77 
 
 		 434 aa  241  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  44.53 
 
 		 435 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  44.44 
 
 		 445 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.33 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  44.61 
 
 		 437 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  44.89 
 
 		 435 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7147  major facilitator superfamily MFS_1  49.45 
 
 		 435 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.604995 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  44.4 
 
 		 433 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5189  major facilitator transporter  50.19 
 
 		 435 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.593783  normal  0.0498797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  52.25 
 
 		 440 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  52.25 
 
 		 440 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  44.16 
 
 		 435 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 445 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0039  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 438 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  52.63 
 
 		 433 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 441 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.38 
 
 		 441 aa  238  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  51.6 
 
 		 440 aa  238  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 441 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  51.8 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  51.09 
 
 		 439 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 441 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 452 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 434 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  44.56 
 
 		 442 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 441 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 434 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 434 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 441 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.77 
 
 		 442 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  45.28 
 
 		 433 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5460  major facilitator superfamily MFS_1  48.54 
 
 		 450 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 434 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 442 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>