More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1855 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 441 aa  865    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  91.08 
 
 		 445 aa  702    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  67.15 
 
 		 435 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1472  major facilitator transporter  74.71 
 
 		 448 aa  541  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137631 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  65.01 
 
 		 430 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  63.46 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  63.62 
 
 		 430 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2075  major facilitator transporter  68.24 
 
 		 435 aa  508  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  53.46 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5327  major facilitator transporter  50.25 
 
 		 436 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3497  major facilitator transporter  50 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.61978  hitchhiker  0.00838162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  45.58 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2524  major facilitator transporter  50.25 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5094  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0811378  normal  0.190217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  44.88 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 449 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  45.77 
 
 		 439 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 		 439 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  45.32 
 
 		 435 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.43 
 
 		 439 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  45.64 
 
 		 452 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 452 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3929  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 436 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3591  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 458 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  44.44 
 
 		 432 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7147  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 		 435 aa  349  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.604995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  43.63 
 
 		 432 aa  348  8e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  42.01 
 
 		 442 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3079  major facilitator transporter  46.6 
 
 		 457 aa  345  7e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  47.38 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  45.22 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  47.38 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  45.52 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  47.38 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1097  major facilitator family transporter  53.25 
 
 		 431 aa  343  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0387869  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  44.53 
 
 		 433 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  44.84 
 
 		 432 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  45.93 
 
 		 437 aa  339  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  49.21 
 
 		 443 aa  339  7e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 434 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 434 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  41.76 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1389  major facilitator family transporter  53 
 
 		 751 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0215  major facilitator family transporter  53 
 
 		 751 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25421  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0950  major facilitator family transporter  53 
 
 		 751 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.601633  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5189  major facilitator transporter  52.68 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.593783  normal  0.0498797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0348  major facilitator family transporter  52.87 
 
 		 431 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0430  major facilitator family transporter  53 
 
 		 797 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1799  major facilitator family transporter  52.87 
 
 		 431 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118328  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1884  major facilitator family transporter  53.12 
 
 		 431 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530062  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  45.63 
 
 		 444 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  46.19 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  45.86 
 
 		 444 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  46.62 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  45.67 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  45.54 
 
 		 435 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  44.65 
 
 		 450 aa  326  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  45.07 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  44.29 
 
 		 440 aa  326  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 459 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 454 aa  322  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  45.43 
 
 		 435 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  45.77 
 
 		 435 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  45.58 
 
 		 440 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  45.54 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  45.65 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  45.65 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  45.65 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  45.65 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  44.61 
 
 		 439 aa  319  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  45.27 
 
 		 437 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  42.73 
 
 		 445 aa  319  5e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  43.29 
 
 		 449 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 462 aa  319  7e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 440 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  45.95 
 
 		 440 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  45.37 
 
 		 444 aa  316  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  43.85 
 
 		 441 aa  316  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  43.85 
 
 		 441 aa  316  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  42.41 
 
 		 443 aa  315  9e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5738  major facilitator superfamily MFS_1  43.67 
 
 		 445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  45.19 
 
 		 456 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 437 aa  313  5.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  43.24 
 
 		 443 aa  312  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  45.08 
 
 		 444 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 		 424 aa  312  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  41.04 
 
 		 433 aa  312  9e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 440 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  40.71 
 
 		 451 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 452 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  44.62 
 
 		 430 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  41.27 
 
 		 440 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>