More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5189 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5189  major facilitator transporter  100 
 
 
435 aa  855    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.593783  normal  0.0498797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5327  major facilitator transporter  69.05 
 
 
436 aa  584  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3497  major facilitator transporter  69.05 
 
 
436 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.61978  hitchhiker  0.00838162 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1097  major facilitator family transporter  80.94 
 
 
431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0387869  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7147  major facilitator superfamily MFS_1  75.59 
 
 
435 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.604995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2524  major facilitator transporter  68.82 
 
 
436 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0348  major facilitator family transporter  81.88 
 
 
431 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1799  major facilitator family transporter  81.88 
 
 
431 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118328  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5094  major facilitator transporter  70.59 
 
 
436 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0811378  normal  0.190217 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0950  major facilitator family transporter  81.97 
 
 
751 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.601633  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0430  major facilitator family transporter  80.69 
 
 
797 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1389  major facilitator family transporter  81.73 
 
 
751 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0215  major facilitator family transporter  81.73 
 
 
751 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25421  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1884  major facilitator family transporter  82.12 
 
 
431 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3591  major facilitator transporter  68.59 
 
 
436 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163155  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3929  major facilitator transporter  68.59 
 
 
436 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  51.74 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5738  major facilitator superfamily MFS_1  51.8 
 
 
445 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  51.5 
 
 
430 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  49.26 
 
 
431 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  50.5 
 
 
430 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  48.66 
 
 
435 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  52.68 
 
 
441 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  54.88 
 
 
445 aa  361  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2075  major facilitator transporter  51.92 
 
 
435 aa  347  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1472  major facilitator transporter  51.83 
 
 
448 aa  333  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  43.62 
 
 
435 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  42.97 
 
 
437 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  44.39 
 
 
440 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  42.53 
 
 
434 aa  294  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  40.54 
 
 
437 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  45.21 
 
 
435 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  38.41 
 
 
437 aa  291  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  39.51 
 
 
437 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  41.53 
 
 
442 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.06 
 
 
439 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  40.82 
 
 
439 aa  289  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  41.52 
 
 
436 aa  289  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  41.52 
 
 
432 aa  289  8e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  41.85 
 
 
434 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  41.85 
 
 
434 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  41.85 
 
 
434 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  41.85 
 
 
434 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  41.98 
 
 
439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  42.89 
 
 
449 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  38.83 
 
 
462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  43.65 
 
 
444 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 
444 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  41.12 
 
 
434 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  43.91 
 
 
442 aa  279  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  41.12 
 
 
445 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  43.86 
 
 
443 aa  278  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  38.62 
 
 
432 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  40.63 
 
 
434 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  40.83 
 
 
439 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.79 
 
 
442 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  40.88 
 
 
434 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  44.59 
 
 
442 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  41.61 
 
 
440 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  40.84 
 
 
442 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  38.2 
 
 
443 aa  272  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  37.71 
 
 
454 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  38.77 
 
 
436 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  38.77 
 
 
436 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  39.63 
 
 
432 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  38.14 
 
 
441 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  38.77 
 
 
436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 
424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  41.76 
 
 
458 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  39.66 
 
 
441 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  38.93 
 
 
451 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  39.66 
 
 
441 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  42.96 
 
 
433 aa  270  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  38.37 
 
 
435 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  38.08 
 
 
441 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  39.71 
 
 
433 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  40.15 
 
 
452 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  39.9 
 
 
452 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  37.89 
 
 
435 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  37.89 
 
 
435 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  39.46 
 
 
441 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  37.89 
 
 
435 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 
440 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  37.56 
 
 
441 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  40.63 
 
 
435 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  42.68 
 
 
436 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  39.46 
 
 
441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  37.56 
 
 
459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  39.35 
 
 
433 aa  266  4e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  39.41 
 
 
441 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  37.44 
 
 
441 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  37.94 
 
 
441 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  39.07 
 
 
442 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  39.1 
 
 
433 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  38.88 
 
 
432 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  38.13 
 
 
435 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  37.94 
 
 
441 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2562  major facilitator transporter  37.53 
 
 
438 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.144453  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1999  major facilitator transporter  41.35 
 
 
443 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0211395  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  41.36 
 
 
435 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>