More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5690 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  93.89 
 
 		 442 aa  798    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  82.57 
 
 		 443 aa  654    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 442 aa  866    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  68.81 
 
 		 442 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  65.57 
 
 		 436 aa  538  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  66.59 
 
 		 434 aa  518  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  64.78 
 
 		 437 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  63.41 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  58.63 
 
 		 439 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09210  MFS transporter  63.62 
 
 		 467 aa  458  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  58.77 
 
 		 440 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  59.24 
 
 		 440 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  55.61 
 
 		 445 aa  441  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2388  major facilitator transporter  51.77 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1403  major facilitator transporter  51.77 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.197119  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02172  predicted transporter  51.54 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1412  major facilitator superfamily MFS_1  51.54 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.787988  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  51.76 
 
 		 429 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2400  major facilitator transporter  51.3 
 
 		 429 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02131  hypothetical protein  51.54 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  51.76 
 
 		 429 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2426  transporter, major facilitator family  51.76 
 
 		 429 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2475  major facilitator family protein  51.76 
 
 		 429 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2634  major facilitator family transporter  51.53 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  50 
 
 		 433 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1456  major facilitator superfamily MFS_1  53.62 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  46.44 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 449 aa  365  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  45.08 
 
 		 434 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  45.08 
 
 		 434 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2512  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 434 aa  355  8.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 450 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  44.02 
 
 		 450 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  43.78 
 
 		 455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 444 aa  338  9e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  41.29 
 
 		 428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 444 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  49.35 
 
 		 430 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  43.14 
 
 		 450 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  45.57 
 
 		 440 aa  331  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  43.9 
 
 		 432 aa  326  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  48.92 
 
 		 443 aa  326  5e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 443 aa  322  6e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 442 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 442 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  43.14 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  45.31 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 448 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 452 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  43.37 
 
 		 469 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  43.37 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  43.37 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  43.37 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  43.37 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  43.37 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 464 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 		 433 aa  316  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 441 aa  316  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  42.55 
 
 		 443 aa  316  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  41.91 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  44.15 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  44.04 
 
 		 440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 448 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 454 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 441 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 441 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 		 443 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 441 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 441 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 455 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  41.38 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 448 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 448 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  42.44 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4906  major facilitator superfamily MFS_1  42.72 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.291929  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 448 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  45.72 
 
 		 442 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 441 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  43.33 
 
 		 433 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  43.4 
 
 		 424 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  45.31 
 
 		 439 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  42.45 
 
 		 469 aa  308  9e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  41.54 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  45.76 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  42.68 
 
 		 447 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  40.96 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 444 aa  307  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  44.62 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  43.16 
 
 		 432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>