More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1456 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1456  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
446 aa  865    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62445  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  59.35 
 
 
439 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  53.02 
 
 
436 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  51.93 
 
 
445 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  53.11 
 
 
442 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.24 
 
 
442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  52.13 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  56.02 
 
 
437 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  53.12 
 
 
440 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  52.4 
 
 
440 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  51.2 
 
 
434 aa  393  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  52.14 
 
 
442 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  54.08 
 
 
443 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  45.28 
 
 
433 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  46.38 
 
 
455 aa  361  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09210  MFS transporter  53.56 
 
 
467 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  43.06 
 
 
429 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2475  major facilitator family protein  43.06 
 
 
429 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424058  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  43.06 
 
 
429 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2426  transporter, major facilitator family  43.06 
 
 
429 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2400  major facilitator transporter  42.19 
 
 
429 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2634  major facilitator family transporter  42.59 
 
 
429 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2388  major facilitator transporter  41.96 
 
 
429 aa  347  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1403  major facilitator transporter  41.96 
 
 
429 aa  347  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.197119  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02172  predicted transporter  41.72 
 
 
429 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02131  hypothetical protein  41.72 
 
 
429 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1412  major facilitator superfamily MFS_1  41.72 
 
 
429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.787988  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  44.15 
 
 
449 aa  340  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  42.79 
 
 
434 aa  327  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  42.79 
 
 
434 aa  326  5e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2512  major facilitator transporter  42.55 
 
 
434 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  46.07 
 
 
430 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  40.86 
 
 
450 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  40.38 
 
 
450 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  41.5 
 
 
428 aa  317  2e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  40.14 
 
 
450 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  40.14 
 
 
455 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  45.03 
 
 
444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  44.76 
 
 
444 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  40.91 
 
 
437 aa  311  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  44.61 
 
 
459 aa  310  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  40.91 
 
 
436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  42.38 
 
 
442 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  42.38 
 
 
442 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  42.38 
 
 
442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  39.78 
 
 
464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  46.9 
 
 
443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 
440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  40.15 
 
 
447 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  40.19 
 
 
437 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  46.19 
 
 
439 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  40.86 
 
 
441 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 
444 aa  299  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  42.32 
 
 
441 aa  299  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  43.75 
 
 
454 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  39.29 
 
 
452 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.61 
 
 
443 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  42.41 
 
 
441 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  40.48 
 
 
441 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  40.29 
 
 
440 aa  296  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  39.6 
 
 
442 aa  296  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  39.6 
 
 
441 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  41.21 
 
 
443 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  40.24 
 
 
441 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  40.24 
 
 
441 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  39.67 
 
 
437 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  38.6 
 
 
454 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  40.14 
 
 
441 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  41.07 
 
 
432 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  40.14 
 
 
441 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  39.35 
 
 
448 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  40 
 
 
441 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  38.24 
 
 
455 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  41.1 
 
 
442 aa  292  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  38.96 
 
 
445 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  38.68 
 
 
439 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  38.37 
 
 
451 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  40.89 
 
 
442 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  44.35 
 
 
424 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  38.19 
 
 
433 aa  289  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  38.35 
 
 
433 aa  289  7e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  37.16 
 
 
432 aa  289  9e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  39.19 
 
 
469 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  41.2 
 
 
442 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  38.95 
 
 
469 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  38.1 
 
 
448 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  40.97 
 
 
428 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  38.95 
 
 
440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  38.95 
 
 
440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  38.95 
 
 
440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  38.95 
 
 
440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  38.95 
 
 
440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5498  major facilitator transporter  42.56 
 
 
455 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  42.62 
 
 
435 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  38.95 
 
 
445 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  42.78 
 
 
445 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  40.71 
 
 
442 aa  286  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1091  major facilitator transporter  43.08 
 
 
455 aa  285  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.768657  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2220  major facilitator transporter  42.31 
 
 
453 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.896585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2098  major facilitator transporter  42.17 
 
 
453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>