More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3284 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  77.12 
 
 		 450 aa  671    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  77.37 
 
 		 455 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  100 
 
 		 441 aa  887    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  97.28 
 
 		 448 aa  805    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  77.49 
 
 		 450 aa  685    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  90.4 
 
 		 448 aa  738    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  77.26 
 
 		 450 aa  680    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  70.64 
 
 		 464 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  73.24 
 
 		 455 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  69.59 
 
 		 447 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  70.36 
 
 		 443 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  67.29 
 
 		 442 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5498  major facilitator transporter  68.23 
 
 		 455 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2098  major facilitator transporter  67.67 
 
 		 453 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5896  major facilitator transporter  68.83 
 
 		 455 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193247  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2220  major facilitator transporter  67.92 
 
 		 453 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.896585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2198  major facilitator transporter  68.83 
 
 		 455 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2181  major facilitator transporter  68.83 
 
 		 455 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576704  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1091  major facilitator transporter  65.51 
 
 		 455 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.768657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 436 aa  349  7e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  42.39 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 		 445 aa  330  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 		 442 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  41.01 
 
 		 432 aa  325  9e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.03 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 442 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 442 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  40.42 
 
 		 440 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  42.72 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 445 aa  317  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  44.04 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4257  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139885  normal  0.0686355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  39.26 
 
 		 440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  40 
 
 		 435 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  37 
 
 		 442 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 440 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  40.88 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  41.92 
 
 		 428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  41.28 
 
 		 442 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  40.57 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 442 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  38.67 
 
 		 441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  41.16 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.73 
 
 		 439 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2830  major facilitator family transporter  41.35 
 
 		 450 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 440 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 		 440 aa  303  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  39.37 
 
 		 443 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 452 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  40.39 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  38.63 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 442 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  39.3 
 
 		 432 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 443 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  37.79 
 
 		 432 aa  299  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  41.95 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 462 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  40.29 
 
 		 445 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 441 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  40.6 
 
 		 437 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  41.71 
 
 		 433 aa  297  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 456 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2952  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 433 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  39.61 
 
 		 437 aa  295  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 440 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  39.77 
 
 		 443 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  35.63 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  38.66 
 
 		 469 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>