More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1619 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  100 
 
 		 439 aa  875    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  65.94 
 
 		 440 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  64.49 
 
 		 440 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  58.63 
 
 		 442 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.81 
 
 		 442 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  56.44 
 
 		 436 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  57.71 
 
 		 439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  59.5 
 
 		 443 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  56.74 
 
 		 434 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09210  MFS transporter  60 
 
 		 467 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  55.36 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  56.77 
 
 		 437 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  50.57 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  50 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1456  major facilitator superfamily MFS_1  53.67 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62445  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2388  major facilitator transporter  46.78 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  46.45 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1403  major facilitator transporter  46.78 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.197119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2426  transporter, major facilitator family  46.45 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2475  major facilitator family protein  46.45 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2400  major facilitator transporter  46.54 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02172  predicted transporter  46.54 
 
 		 429 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1412  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.787988  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  46.21 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02131  hypothetical protein  46.54 
 
 		 429 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2634  major facilitator family transporter  46.21 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  44.8 
 
 		 455 aa  354  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 449 aa  343  4e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  42.62 
 
 		 428 aa  340  2e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2512  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 437 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  41.86 
 
 		 450 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  42.02 
 
 		 450 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  41.78 
 
 		 455 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  42.02 
 
 		 450 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 455 aa  315  9e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  42.15 
 
 		 464 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 442 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  41.05 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  40.57 
 
 		 432 aa  309  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  41.3 
 
 		 443 aa  309  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  42.63 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  42.63 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 		 442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  41.06 
 
 		 447 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 437 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  40.83 
 
 		 443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 436 aa  306  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  45.83 
 
 		 430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  42.86 
 
 		 433 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  43.32 
 
 		 432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 448 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 448 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 448 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 441 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 441 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 439 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 441 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  43.98 
 
 		 436 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  43.91 
 
 		 444 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 454 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2198  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 455 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5896  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 		 444 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2181  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576704  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  41.46 
 
 		 441 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 441 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 442 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  46.07 
 
 		 443 aa  299  7e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1091  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 455 aa  299  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.768657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 442 aa  299  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5498  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  41.72 
 
 		 428 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  42.25 
 
 		 442 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2098  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 453 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2220  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 453 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.896585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 437 aa  297  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 448 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  42.31 
 
 		 432 aa  297  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  40.33 
 
 		 432 aa  297  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 455 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.39 
 
 		 439 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  43.93 
 
 		 444 aa  296  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 448 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>