More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2181 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1091  major facilitator transporter  90.99 
 
 		 455 aa  797    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.768657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2198  major facilitator transporter  99.56 
 
 		 455 aa  914    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5498  major facilitator transporter  97.58 
 
 		 455 aa  847    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2098  major facilitator transporter  94.68 
 
 		 453 aa  812    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  75.18 
 
 		 443 aa  640    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5896  major facilitator transporter  100 
 
 		 455 aa  917    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193247  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2220  major facilitator transporter  95.12 
 
 		 453 aa  818    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.896585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2181  major facilitator transporter  100 
 
 		 455 aa  917    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  63.33 
 
 		 455 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  63.1 
 
 		 450 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  64.37 
 
 		 447 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  66.28 
 
 		 464 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  62.41 
 
 		 450 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  63.62 
 
 		 450 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  65.21 
 
 		 455 aa  549  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  63.49 
 
 		 442 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  68.4 
 
 		 441 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  67.99 
 
 		 448 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  66.17 
 
 		 448 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  41.99 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.76 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  43.63 
 
 		 439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 		 445 aa  308  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  41.31 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  41.55 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  39.71 
 
 		 469 aa  300  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.47 
 
 		 439 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  39.71 
 
 		 469 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 439 aa  299  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 435 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  39.58 
 
 		 434 aa  299  7e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  39.71 
 
 		 440 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  39.71 
 
 		 440 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  39.71 
 
 		 440 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  39.71 
 
 		 440 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  39.71 
 
 		 440 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 434 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 		 444 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 434 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  40.85 
 
 		 435 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 441 aa  296  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  43.01 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  40.6 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 442 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  40 
 
 		 440 aa  294  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  41.99 
 
 		 437 aa  294  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  38.1 
 
 		 441 aa  292  7e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  40.09 
 
 		 440 aa  292  7e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 436 aa  292  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  39.67 
 
 		 432 aa  292  9e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 441 aa  292  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  39.1 
 
 		 432 aa  292  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  44.13 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  39.82 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  39.61 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 434 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  39.37 
 
 		 441 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  40.92 
 
 		 437 aa  289  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 442 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  39.37 
 
 		 441 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 441 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 452 aa  289  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 428 aa  289  9e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  39 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  39.37 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 442 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 442 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  41.57 
 
 		 424 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 445 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 440 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4257  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 444 aa  286  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139885  normal  0.0686355 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0200  major facilitator family transporter  39.09 
 
 		 441 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  39.8 
 
 		 462 aa  286  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  37.16 
 
 		 443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  39.12 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  38.9 
 
 		 445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 437 aa  283  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 436 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 436 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 442 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 		 455 aa  282  8.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 442 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 436 aa  282  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 459 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  38.88 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>