More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6622 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
439 aa  862    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  68.89 
 
 
436 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  66.67 
 
 
434 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  67.82 
 
 
437 aa  511  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  63.41 
 
 
442 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  56.36 
 
 
445 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  62.08 
 
 
442 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  57.71 
 
 
439 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  63.71 
 
 
443 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  61.67 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  56.64 
 
 
440 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09210  MFS transporter  64.05 
 
 
467 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  56.88 
 
 
440 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1456  major facilitator superfamily MFS_1  59.35 
 
 
446 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62445  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2475  major facilitator family protein  50.95 
 
 
429 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424058  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  50.71 
 
 
429 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2634  major facilitator family transporter  50.71 
 
 
429 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2426  transporter, major facilitator family  50.95 
 
 
429 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  50.95 
 
 
429 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2388  major facilitator transporter  50.47 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1403  major facilitator transporter  50.47 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.197119  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2400  major facilitator transporter  50.47 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02172  predicted transporter  50.24 
 
 
429 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1412  major facilitator superfamily MFS_1  50.24 
 
 
429 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.787988  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02131  hypothetical protein  50.24 
 
 
429 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  49.77 
 
 
433 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  46.75 
 
 
434 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  46.75 
 
 
434 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2512  major facilitator transporter  46.51 
 
 
434 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  47.74 
 
 
455 aa  375  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  47.6 
 
 
437 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  46.08 
 
 
428 aa  350  4e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  43.75 
 
 
449 aa  350  4e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  47.09 
 
 
464 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  47.83 
 
 
442 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  44.07 
 
 
450 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  43.33 
 
 
450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  43.5 
 
 
455 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  47.57 
 
 
442 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  44.73 
 
 
442 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  47.57 
 
 
442 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  43.03 
 
 
450 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  44.55 
 
 
437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  45.15 
 
 
447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  45.81 
 
 
436 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  44.93 
 
 
437 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  46.94 
 
 
437 aa  332  6e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  42.12 
 
 
455 aa  332  8e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  43.5 
 
 
443 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  43.14 
 
 
443 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  45.52 
 
 
440 aa  330  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  44.23 
 
 
441 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  44.63 
 
 
441 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  47.03 
 
 
440 aa  326  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  44.42 
 
 
441 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  43.75 
 
 
441 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  44.04 
 
 
439 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  47.41 
 
 
442 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  43.2 
 
 
456 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  44.15 
 
 
441 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  44.52 
 
 
443 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  44.15 
 
 
441 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  47.91 
 
 
442 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  43.14 
 
 
448 aa  322  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  43.9 
 
 
441 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  48.34 
 
 
442 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  45.35 
 
 
442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  47.98 
 
 
443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  44.12 
 
 
434 aa  319  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  42.89 
 
 
441 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  44.12 
 
 
434 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  43.26 
 
 
432 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  44.12 
 
 
434 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  44.12 
 
 
434 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  42.79 
 
 
442 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  43.65 
 
 
434 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  41.36 
 
 
448 aa  316  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  43.88 
 
 
434 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  44.87 
 
 
430 aa  316  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  41.51 
 
 
443 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  42.37 
 
 
469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1091  major facilitator transporter  44.12 
 
 
455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.768657  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  42.49 
 
 
454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  42.37 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  42.37 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  42.37 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  42.37 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  47.63 
 
 
444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.37 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  44.58 
 
 
444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  39.29 
 
 
441 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  42.13 
 
 
469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  44.58 
 
 
444 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  44.15 
 
 
442 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  42.14 
 
 
432 aa  312  6.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  42.36 
 
 
442 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  43.19 
 
 
433 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  39.06 
 
 
441 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  44.36 
 
 
432 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  40.44 
 
 
451 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>