More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2400 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02172  predicted transporter  98.83 
 
 		 429 aa  840    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1412  major facilitator superfamily MFS_1  98.83 
 
 		 429 aa  840    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.787988  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  92.07 
 
 		 429 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2388  major facilitator transporter  99.07 
 
 		 429 aa  842    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2475  major facilitator family protein  92.31 
 
 		 429 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1403  major facilitator transporter  99.07 
 
 		 429 aa  842    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.197119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2426  transporter, major facilitator family  92.31 
 
 		 429 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02131  hypothetical protein  98.83 
 
 		 429 aa  840    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  92.07 
 
 		 429 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2400  major facilitator transporter  100 
 
 		 429 aa  848    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2634  major facilitator family transporter  92.07 
 
 		 429 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3384  major facilitator superfamily MFS_1  98.81 
 
 		 252 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  54.27 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  55.1 
 
 		 434 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2512  major facilitator transporter  54.27 
 
 		 434 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  51.3 
 
 		 442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  51.07 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.64 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  50.72 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  47.1 
 
 		 445 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  52.25 
 
 		 437 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  51.87 
 
 		 439 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  52.41 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  47.37 
 
 		 440 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  47.73 
 
 		 442 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  46.54 
 
 		 439 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  46.65 
 
 		 440 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09210  MFS transporter  50.35 
 
 		 467 aa  355  6.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3387  transporter, major facilitator family  99.42 
 
 		 185 aa  346  5e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 433 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  40.51 
 
 		 455 aa  323  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1456  major facilitator superfamily MFS_1  44.22 
 
 		 446 aa  317  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 449 aa  308  9e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  36.34 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  40.91 
 
 		 432 aa  285  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 430 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  43.4 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 437 aa  276  6e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  39.41 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  39.41 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  39.41 
 
 		 436 aa  274  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 442 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 442 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 442 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 437 aa  272  9e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  39.12 
 
 		 448 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  39.12 
 
 		 448 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 448 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 444 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  37.18 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  35.13 
 
 		 435 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  38 
 
 		 443 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 		 449 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 444 aa  267  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 437 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 443 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  38.55 
 
 		 440 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  38.55 
 
 		 469 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  38.55 
 
 		 440 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  38.55 
 
 		 440 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  38.55 
 
 		 440 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 450 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  38.55 
 
 		 440 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  35.81 
 
 		 455 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 428 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  38.65 
 
 		 440 aa  266  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  40.47 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  38.67 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  38.07 
 
 		 469 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 450 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 440 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0039  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 443 aa  262  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 441 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 436 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 441 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 424 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 441 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 441 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  37.88 
 
 		 432 aa  259  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 450 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  38.25 
 
 		 435 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 448 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  38.9 
 
 		 442 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 441 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  38.78 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 433 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  39.08 
 
 		 432 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 435 aa  256  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  39.08 
 
 		 439 aa  256  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>