More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02131 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02172  predicted transporter  100 
 
 
429 aa  849    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1412  major facilitator superfamily MFS_1  99.53 
 
 
429 aa  843    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.787988  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  91.38 
 
 
429 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2634  major facilitator family transporter  91.38 
 
 
429 aa  789    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2475  major facilitator family protein  91.61 
 
 
429 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424058  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1403  major facilitator transporter  99.77 
 
 
429 aa  846    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.197119  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2400  major facilitator transporter  98.83 
 
 
429 aa  840    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  91.38 
 
 
429 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2388  major facilitator transporter  99.77 
 
 
429 aa  846    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2426  transporter, major facilitator family  91.61 
 
 
429 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02131  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  849    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3384  major facilitator superfamily MFS_1  98.81 
 
 
252 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2512  major facilitator transporter  53.55 
 
 
434 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  53.55 
 
 
434 aa  463  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  54.37 
 
 
434 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  51.54 
 
 
442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  50.59 
 
 
436 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.4 
 
 
442 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  50.48 
 
 
434 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 
445 aa  385  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  51.62 
 
 
439 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  51.5 
 
 
437 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  51.9 
 
 
443 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  46.89 
 
 
440 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  46.54 
 
 
439 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  47.47 
 
 
442 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  46.17 
 
 
440 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09210  MFS transporter  49.65 
 
 
467 aa  352  8.999999999999999e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3387  transporter, major facilitator family  99.42 
 
 
185 aa  345  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
455 aa  321  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  41.73 
 
 
433 aa  321  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1456  major facilitator superfamily MFS_1  43.72 
 
 
446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  39.8 
 
 
449 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  36.1 
 
 
428 aa  289  8e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  40.43 
 
 
432 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 
430 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  37.68 
 
 
437 aa  272  8.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  39.16 
 
 
436 aa  272  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  39.16 
 
 
436 aa  272  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  42.64 
 
 
445 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  36.36 
 
 
437 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  37.06 
 
 
442 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  39.16 
 
 
436 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  38.46 
 
 
442 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  37.89 
 
 
442 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  38.89 
 
 
448 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  38.89 
 
 
448 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  37.89 
 
 
442 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  39.47 
 
 
448 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  39.62 
 
 
455 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  37.44 
 
 
437 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  34.89 
 
 
435 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  39.32 
 
 
444 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  37.77 
 
 
443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  36.72 
 
 
451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  39.76 
 
 
441 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  39.06 
 
 
444 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  36.84 
 
 
437 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  35.58 
 
 
455 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  35.58 
 
 
450 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  42.01 
 
 
443 aa  264  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  38.07 
 
 
440 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  38.07 
 
 
440 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 
449 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  38.07 
 
 
469 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  38.07 
 
 
440 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  38.07 
 
 
440 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  38.07 
 
 
440 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  39.28 
 
 
428 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  39.04 
 
 
433 aa  263  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 
440 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  36.02 
 
 
440 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  37.83 
 
 
469 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  40 
 
 
432 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  35.35 
 
 
450 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0039  major facilitator transporter  35.84 
 
 
438 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  37.89 
 
 
441 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  37.77 
 
 
441 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  37.97 
 
 
443 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  39.42 
 
 
440 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  37.65 
 
 
441 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  38.26 
 
 
441 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  36.79 
 
 
436 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  38.78 
 
 
441 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  38.26 
 
 
441 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  36.26 
 
 
434 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 
424 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  38.05 
 
 
442 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  34.34 
 
 
450 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  37.41 
 
 
432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  37.1 
 
 
435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  37.59 
 
 
441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  38.55 
 
 
442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  38.26 
 
 
441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  38.62 
 
 
432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  35.9 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  38.19 
 
 
442 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  36.88 
 
 
442 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  38.7 
 
 
435 aa  253  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>